RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PS29	197 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688		A8MXE2	369 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688		H7C1Q1	480 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	OR10H2	O60403	315 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	NPHS1	O60500	1241 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ULK1	O75385	1050 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	GPR75	O95800	540 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	KRT6A	P02538	564 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	KRT6B	P04259	564 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SERPINE1	P05121	402 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CRH	P06850	196 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SLC35E2	P0CK97	266 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	NAGA	P17050	411 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PCSK6	P29122	969 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	BSG	P35613	385 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PIK3CB	P42338	1070 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CASP3	P42574	277 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SLC1A6	P48664	564 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	KRT6C	P48668	564 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ALDH9A1	P49189	494 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	WNT3	P56703	355 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ERVK-8	P63133	956 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TNFRSF17	Q02223	184 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	STX3	Q13277	289 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TOMM20	Q15388	145 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ACKR1	Q16570	336 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	NUDT13	Q86X67	352 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	WNT2B	Q93097	391 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	RGMA	Q96B86	450 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	C3orf30	Q96M34	536 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688		Q96MF0	132 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	GNRHR2	Q96P88	292 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SORT1	Q99523	831 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SERPINI1	Q99574	410 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	C1orf50	Q9BV19	199 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	WDR41	Q9HAD4	459 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	GALNT8	Q9NY28	637 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	ACAN	P16112	2415 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	DNAJC13	O75165	2243 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688		A0A0A6YYD5	115 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PPR1	153 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PR48	441 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TMEM114	B3SHH9	223 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	HRK	O00198	91 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	MSTN	O14793	375 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	BIRC5	O15392	142 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PCDH7	O60245	1069 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	TMCC2	O75069	709 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	CBR3	O75828	277 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	LRAT	O95237	230 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	AIFM1	O95831	613 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	UROS	P10746	265 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	PTPN6	P29350	595 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	MC3R	P41968	323 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	MAPK12	P53778	367 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	FBXW4	P57775	412 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
CS-233	ENST00000552688	FUT7	Q11130	342 aa		6.23	□□□□□ -1.41

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