RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		11.37	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	STAB1	Q9NY15	2570 aa		11.37	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	ESYT3	A0FGR9	886 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	TRIM64B	A6NI03	449 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC22A20	A6NK97	555 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931		H0YC42	278 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	RBP1	P09455	135 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	CRYGS	P22914	178 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	DPP4	P27487	766 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	PCSK6	P29122	969 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	CD79B	P40259	229 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	MC3R	P41968	323 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	CDH13	P55290	713 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	CLDN15	P56746	228 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	SIRPA	P78324	504 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	ACKR1	Q16570	336 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF550	Q7Z398	422 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	FIG4	Q92562	907 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	PIGT	Q969N2	578 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	PERP	Q96FX8	193 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	PGM2	Q96G03	612 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	MARK4	Q96L34	752 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	VSTM2L	Q96N03	204 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	CCL19	Q99731	98 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	MED18	Q9BUE0	208 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	BRF2	Q9HAW0	419 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	PSME2	Q9UL46	239 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	SMIM24	O75264	130 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	OTC	P00480	354 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	CRH	P06850	196 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	IL3	P08700	152 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	SBK3	P0C264	359 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	IL12B	P29460	328 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	UGT2B10	P36537	528 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	PCYT1A	P49585	367 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	EFR3A	Q14156	821 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	BCL2A1	Q16548	175 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	OR2A2	Q6IF42	318 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	11.35	□□□□□ -0.59	4e-6	■■■□□ 17.7
LETMD1-231	ENST00000551931	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	TMCO1	Q9UM00	188 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	SCO2	O43819	266 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	OR4F21	O95013	312 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	ESRRB	O95718	433 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	CGA	P01215	116 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	POU2F1	P14859	743 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	CHN1	P15882	459 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	FPR1	P21462	350 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	PNLIPRP2	P54317	469 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC7A5	Q01650	507 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	FADS6	Q8N9I5	356 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	OR2M3	Q8NG83	312 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	OR7G2	Q8NG99	324 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	BDH2	Q9BUT1	245 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	PINK1	Q9BXM7	581 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	DSN1	Q9H410	356 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	MCM8	Q9UJA3	840 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	SNX6	Q9UNH7	406 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	ABCA1	O95477	2261 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-231	ENST00000551931	CUBN	O60494	3623 aa		11.33	□□□□□ -0.6

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