RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	REEP4	Q9H6H4	257 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137		Q9UFV3	132 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	RAB21	Q9UL25	225 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	CD8B2	A6NJW9	211 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	HSPB2	A8KAH6	182 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	GNB5	O14775	395 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	FADS1	O60427	444 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	SPAG7	O75391	227 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	BPGM	P07738	259 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	LINC00032	P0C843	101 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	BMP7	P18075	431 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	ARRB2	P32121	409 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	KRT20	P35900	424 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	MLC1	Q15049	377 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	HSPB2	Q16082	182 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	LACC1	Q8IV20	430 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	UCN2	Q96RP3	112 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	MECR	Q9BV79	373 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	SERHL	Q9NQF3	203 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CS-223	ENST00000551137	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	TMEM233	B4DJY2	109 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	BIRC5	O15392	142 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	PDPK1	O15530	556 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	IL33	O95760	270 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	CREB1	P16220	341 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	CAPN3	P20807	821 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	IL12B	P29460	328 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	SRD5A2	P31213	254 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	GFRA1	P56159	465 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ZNF844	Q08AG5	666 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	GAB1	Q13480	694 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	EIPR1	Q53HC9	387 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ZNF385B	Q569K4	471 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	TMEM107	Q6UX40	140 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	PPCDC	Q96CD2	204 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ZIM3	Q96PE6	472 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	UCK2	Q9BZX2	261 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	CALHM2	Q9HA72	323 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137		Q9N2J8	555 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		10.45	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	C2orf72	A6NCS6	295 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ENO4	A6NNW6	628 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	TMEM114	B3SHH9	223 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	SYT5	O00445	386 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	PIP5K1B	O14986	540 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ZIC3	O60481	467 aa		10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	NKX2-2	O95096	273 aa		10.44	□□□□□ -0.74

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