RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 OMA1Q96E52 524 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 SMR3AQ99954 134 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 TAS2R9Q9NYW1 312 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 SPRR3Q9UBC9 169 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 TLDC2A0PJX2 215 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 HSPB2A8KAH6 182 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 AHRRA9YTQ3 701 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 TSPAN2O60636 221 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 ICOSLGO75144 302 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 UGT2B11O75310 529 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 CRCPO75575 148 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 SLU7O95391 586 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 PSMG1O95456 288 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 NEFHP12036 1026 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 PTPN6P29350 595 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 UQCRC1P31930 480 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 SERPINB5P36952 375 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 PTGDSP41222 190 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 PNLIPRP2P54317 469 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 PLCXD2Q0VAA5 305 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 HSPB2Q16082 182 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 PRSS53Q2L4Q9 553 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 UGT3A2Q3SY77 523 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 KANK2Q63ZY3 851 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 BICRALQ6AI39 1079 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 VASNQ6EMK4 673 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 POMZP3Q6PJE2 187 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 OR7G2Q8NG99 324 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 OR6Y1Q8NGX8 325 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 COL21A1Q96P44 957 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 GNRHR2Q96P88 292 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 BBS4Q96RK4 519 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 CCT7Q99832 543 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 EBPLQ9BY08 206 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 C1orf109Q9NX04 203 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 TMED5Q9Y3A6 229 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 ZANQ9Y493 2812 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 CSPG4Q6UVK1 2322 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 SNPHO15079 494 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 RGS14O43566 566 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 SEC22BO75396 215 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 ERN1O75460 977 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 CBR3O75828 277 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 LRATO95237 230 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 INHBBP09529 407 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 GDF1P27539 372 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 ALDH3A1P30838 453 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 ASCL1P50553 236 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 PSG6Q00889 435 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 IFFO1Q0D2I5 559 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP10.49□□□□□ -0.734e-6■■■□□ 18.9
CS-221ENST00000550734 CYP27C1Q4G0S4 372 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 CLEC6AQ6EIG7 209 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 NPSR1Q6W5P4 371 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 ULK2Q8IYT8 1036 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 PRR22Q8IZ63 422 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 OR2L13Q8N349 312 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 LIX1Q8N485 282 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 WDSUB1Q8N9V3 476 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 TCP10LQ8TDR4 215 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 KAT2AQ92830 837 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 TMCO6Q96DC7 493 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 AMDHD1Q96NU7 426 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 NODALQ96S42 347 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 TIMP4Q99727 224 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 PRDM14Q9GZV8 571 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 SLC6A15Q9H2J7 730 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 TUBB1Q9H4B7 451 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 GLIPR2Q9H4G4 154 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 EXO5Q9H790 373 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 ANKRA2Q9H9E1 313 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 FOLH1BQ9HBA9 442 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 LRTM1Q9HBL6 345 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 MIEF1Q9NQG6 463 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 PFDN4Q9NQP4 134 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 SENP1Q9P0U3 644 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 NTMQ9P121 344 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 TLN2Q9Y4G6 2542 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 MED12Q93074 2177 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 PRAMEF25A6NGN4 478 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 TTC36A6NLP5 189 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 UPK1AO00322 258 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 DVL2O14641 736 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 TYROBPO43914 113 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-221ENST00000550734 COQ9O75208 318 aa10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms