RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 GGT3PA6NGU5 568 aa8.05□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 SLC5A12Q1EHB4 618 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 RAB11FIP2Q7L804 512 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 FGF13Q92913 245 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
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