RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546048.5

MDM2-234, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5

Gene MDM2, Length 363 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-234	ENST00000546048	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	MED12	Q93074	2177 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	UPK1A	O00322	258 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	FCHO1	O14526	889 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	NPHS1	O60500	1241 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67	2e-6	■■□□□ 11.6
MDM2-234	ENST00000546048	SLC19A2	O60779	497 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	PEX11A	O75192	247 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	UGT2B11	O75310	529 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SEC22B	O75396	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	HTR3B	O95264	441 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	PSMG1	O95456	288 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	LAMP1	P11279	417 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	BCKDHA	P12694	445 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	PRF1	P14222	555 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF24	P17028	368 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	CNR1	P21554	472 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	PRPH2	P23942	346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	ABCD3	P28288	659 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	MC3R	P41968	323 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	CA7	P43166	264 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	GAS1	P54826	345 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	WNT3	P56703	355 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	AP2B1	P63010	937 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	PHC1	P78364	1004 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	CHI3L2	Q15782	390 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	INA	Q16352	499 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	NTRK2	Q16620	822 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SPIN4	Q56A73	249 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	DCST1	Q5T197	706 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	RTL6	Q6ICC9	239 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM107	Q6UX40	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	APOOL	Q6UXV4	268 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	RTL4	Q6ZR62	310 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TMBIM1	Q969X1	311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TLCD1	Q96CP7	247 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	CCDC126	Q96EE4	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	GIMAP5	Q96F15	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	MAGED4	Q96JG8	741 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TEX37	Q96LM6	180 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	GNRHR2	Q96P88	292 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TSSK3	Q96PN8	268 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SMC6	Q96SB8	1091 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	C1orf50	Q9BV19	199 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	CENPH	Q9H3R5	247 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	MYNN	Q9NPC7	610 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	C1orf109	Q9NX04	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	SPACA6	W5XKT8	324 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	FBN2	P35556	2912 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	MAST4	O15021	2626 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	OR6C76	A6NM76	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048		C9JVG2	144 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MDM2-234	ENST00000546048	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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