RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541295.5

LMO3-225, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 3,498 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-225ENST00000541295 ITGAMP11215 1152 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 SAT1P21673 171 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 GABRR1P24046 479 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 MGAT1P26572 445 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 PTGER4P35408 488 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 LHX1P48742 406 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 EFNA5P52803 228 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 DEFA5Q01523 94 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 NRF1Q16656 503 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 COL28A1Q2UY09 1125 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 Q5BKY6 102 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 MED27Q6P2C8 311 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 PAQR3Q6TCH7 311 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 C3P1Q6ZMU1 363 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 MTSS1LQ765P7 747 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 SKA3Q8IX90 412 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 MIER2Q8N344 545 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 FRMD1Q8N878 549 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 GDPD1Q8N9F7 314 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 DNAJB3Q8WWF6 145 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 MYO19Q96H55 970 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 TMEM109Q9BVC6 243 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 TLR10Q9BXR5 811 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 IL1RL2Q9HB29 575 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 ICKQ9UPZ9 632 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 KAT6AQ92794 2004 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 SLC35F4A4IF30 521 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 FAM170BA6NMN3 283 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 M0R143 59 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 MDM4O15151 490 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 SEC14L2O76054 403 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 NPSP0C0P6 89 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 NBEAP1P0C6P0 100 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 CD247P20963 164 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 DCTDP32321 178 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 CEACAM3P40198 252 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 PTGFRP43088 359 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 HLCSP50747 726 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 MTM1Q13496 603 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 MEP1AQ16819 746 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 C5orf64Q2M2E5 130 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 ZNF528Q3MIS6 628 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 ANKRD54Q6NXT1 300 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 ZNF529Q6P280 563 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 C16orf89Q6UX73 402 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 ASB18Q6ZVZ8 466 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 ABHD13Q7L211 337 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 TCTE3Q8IZS6 198 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 OR4K14Q8NGD5 310 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 OR2T3Q8NH03 318 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 PPTC7Q8NI37 304 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 LRTOMTQ8WZ04 291 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 HAVCR1Q96D42 359 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 IGSF21Q96ID5 467 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 LINC00052Q96N35 136 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 KCNK17Q96T54 332 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 AGPAT1Q99943 283 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 FUZQ9BT04 418 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 THTPAQ9BU02 230 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 GPR88Q9GZN0 384 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 IPPKQ9H8X2 491 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 KLHL21Q9UJP4 597 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 HIF3AQ9Y2N7 669 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa5.85□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 CDRT15L2A8MXV6 281 aa5.84□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 CXCL8P10145 99 aa5.84□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 MYOGP15173 224 aa5.84□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 SERPINA2P20848 420 aa5.84□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 KCNJ1P48048 391 aa5.84□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 SLC18A2Q05940 514 aa5.84□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 CRHR2Q13324 411 aa5.84□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 LILRA6Q6PI73 481 aa5.84□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 TAS1R1Q7RTX1 841 aa5.84□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 CLNKQ7Z7G1 428 aa5.84□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 TMEM192Q8IY95 271 aa5.84□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 HS3ST5Q8IZT8 346 aa5.84□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 NLGN4XQ8N0W4 816 aa5.84□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 CYB561A3Q8NBI2 242 aa5.84□□□□□ -1.47
LMO3-225ENST00000541295 BEND2Q8NDZ0 799 aa5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms