RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530309.1

CASP4-208, Transcript of caspase 4, human

TSL 2

Gene CASP4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASP4-208	ENST00000530309	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	PRODH2	Q9UF12	536 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	CUX2	O14529	1486 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	C19orf81	C9J6K1	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	AKR7A3	O95154	331 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	APBB3	O95704	486 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	ARHGDIB	P52566	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	HTD2	P86397	168 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	RUNX3	Q13761	415 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	SLC10A1	Q14973	349 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	RAB35	Q15286	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	SPINK14	Q6IE38	97 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	NAXD	Q8IW45	347 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	ART4	Q93070	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	GRIN2D	O15399	1336 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	EFCAB7	A8K855	629 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309		F8WDY8	70 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	VPS26A	O75436	327 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	GJB5	O95377	273 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	HSF2	Q03933	536 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309		Q6ZR54	194 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309		Q7L0L9	218 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	MISP	Q8IVT2	679 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	HSCB	Q8IWL3	235 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	ATP8B3	O60423	1300 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	WASH3P	C4AMC7	463 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	CA3	P07451	260 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	GSTT2	P0CG29	244 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	GSTT2B	P0CG30	244 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	LAMP1	P11279	417 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	DPP4	P27487	766 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	OR1D4	P47884	311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	GPC3	P51654	580 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	PAX2	Q02962	417 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	CDKN3	Q16667	212 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	LGSN	Q5TDP6	509 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	TADA1	Q96BN2	335 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	FICD	Q9BVA6	458 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CASP4-208	ENST00000530309		A0A0U1RQV5	110 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CASP4-208	ENST00000530309	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CASP4-208	ENST00000530309	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CASP4-208	ENST00000530309	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CASP4-208	ENST00000530309	TM9SF1	O15321	606 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CASP4-208	ENST00000530309	RAMP1	O60894	148 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CASP4-208	ENST00000530309	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CASP4-208	ENST00000530309	THY1	P04216	161 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CASP4-208	ENST00000530309	ALPI	P09923	528 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CASP4-208	ENST00000530309	CT45A10	P0DMU9	189 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CASP4-208	ENST00000530309	UMPS	P11172	480 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CASP4-208	ENST00000530309	SDC1	P18827	310 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CASP4-208	ENST00000530309	AXL	P30530	894 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CASP4-208	ENST00000530309	MAGEA9	P43362	315 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CASP4-208	ENST00000530309	FNTA	P49354	379 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CASP4-208	ENST00000530309	SCGB2A2	Q13296	93 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CASP4-208	ENST00000530309	TFDP1	Q14186	410 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CASP4-208	ENST00000530309	UBE2V2	Q15819	145 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CASP4-208	ENST00000530309	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CASP4-208	ENST00000530309	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CASP4-208	ENST00000530309	ARSK	Q6UWY0	536 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CASP4-208	ENST00000530309	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CASP4-208	ENST00000530309	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CASP4-208	ENST00000530309	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CASP4-208	ENST00000530309	VSTM2L	Q96N03	204 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CASP4-208	ENST00000530309	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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