RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 B3GALT5-AS1P59052 145 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 PSPHP78330 225 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 CT45A2Q5DJT8 189 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 OR4F6Q8NGB9 312 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF675Q8TD23 568 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 FIG4Q92562 907 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 ERP27Q96DN0 273 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 MARK4Q96L34 752 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 HS3ST6Q96QI5 342 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 GSX2Q9BZM3 304 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 VPS11Q9H270 941 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 BRF2Q9HAW0 419 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 NMRK1Q9NWW6 199 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 HEY2Q9UBP5 337 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 STAB1Q9NY15 2570 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 B4DXG7 233 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 EMC8O43402 210 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 TNFRSF21O75509 655 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 PDYNP01213 254 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 IL12BP29460 328 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 CCKARP32238 428 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 KCNJ5P48544 419 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 SERPINB8P50452 374 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 CLDN15P56746 228 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 CORO7P57737 925 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 SIRPAP78324 504 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF628Q5EBL2 1059 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF550Q7Z398 422 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 UBQLNLQ8IYU4 475 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 CCDC116Q8IYX3 515 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 MEIOBQ8N635 442 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF610Q8N9Z0 462 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 OR4K17Q8NGC6 315 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 SPATA3Q8NHX4 192 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 SELENOMQ8WWX9 145 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 VSTM2LQ96N03 204 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 ANKRA2Q9H9E1 313 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 PFDN4Q9NQP4 134 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 UTS2RQ9UKP6 389 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRU-210ENST00000527027 NME6O75414 186 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 CD8BP10966 210 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 LOXP28300 417 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 PTH2RP49190 550 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 FGFBP1Q14512 234 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 TRADDQ15628 312 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 ZDHHC24Q6UX98 284 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 C22orf34Q6ZV56 151 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 KAT2AQ92830 837 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 RAB17Q9H0T7 212 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 DSN1Q9H410 356 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 RNF122Q9H9V4 155 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 TRPS1Q9UHF7 1281 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 SNX6Q9UNH7 406 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF175Q9Y473 711 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 ROS1P08922 2347 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 H0YC42 278 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 LINC01387J3KSC0 135 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 PPP6CO00743 305 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 SMIM24O75264 130 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 ESRRBO95718 433 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 OTCP00480 354 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 TBXA2RP21731 343 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 RAET1LQ5VY80 246 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 ANKRD34AQ69YU3 496 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 LETMD1Q6P1Q0 360 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 NPSR1Q6W5P4 371 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 FADS6Q8N9I5 356 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 IGFBPL1Q8WX77 278 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 CAVIN3Q969G5 261 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 PIGQQ9BRB3 760 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 PINK1Q9BXM7 581 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 FOLH1BQ9HBA9 442 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 VPS29Q9UBQ0 182 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 ADAM21Q9UKJ8 722 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF337Q9Y3M9 751 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 MXRA5Q9NR99 2828 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 C17orf51A8MQB3 221 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRU-210ENST00000527027 PAX1P15863 534 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms