RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 DLEU7Q6UYE1 221 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 Q6ZS92 163 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 RNF130Q86XS8 419 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM178AQ8NBL3 297 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 MDS2Q8NDY4 140 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 C16orf58Q96GQ5 468 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 C5orf34Q96MH7 638 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 SH3GL1Q99961 368 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 OR51I1Q9H343 314 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 SLC6A13Q9NSD5 602 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 HS6ST1O60243 411 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 SLC25A12O75746 678 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 TBCELQ5QJ74 424 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM81Q6P7N7 255 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 IL20RBQ6UXL0 311 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 NUP54Q7Z3B4 507 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 ARPINQ7Z6K5 226 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 TREML1Q86YW5 311 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 CLEC4FQ8N1N0 589 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 FBXO30Q8TB52 745 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 DIO2Q92813 273 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 TMBIM1Q969X1 311 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 COL21A1Q96P44 957 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 CGREF1Q99674 301 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 YIPF4Q9BSR8 244 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 EFCAB1Q9HAE3 211 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 CNIH4Q9P003 139 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 VAPAQ9P0L0 249 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 TSPAN2O60636 221 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 NEURL1O76050 574 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 IL33O95760 270 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 CD1EP15812 388 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 MNAT1P51948 309 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 INAQ16352 499 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP17.23■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 GTDC1Q4AE62 458 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 PCSK4Q6UW60 755 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 FAM13CQ8NE31 585 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 PAQR8Q8TEZ7 354 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 CDS1Q92903 461 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 PNPLA2Q96AD5 504 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 TMCO6Q96DC7 493 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 ANKRD27Q96NW4 1050 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 SERHL2Q9H4I8 314 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 ANKRD10Q9NXR5 420 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 PLA2G3Q9NZ20 509 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 MAP10Q9P2G4 905 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 LIPT1Q9Y234 373 aa17.23■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 ATMQ13315 3056 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM247A6NEH6 219 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 NME6O75414 186 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 REM1O75628 298 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 GUSBP08236 651 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 RPS26P62854 115 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 KLRB1Q12918 225 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 KRT72Q14CN4 511 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 HACD2Q6Y1H2 254 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 C16orf62Q7Z3J2 963 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 MSRB3Q8IXL7 192 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 POU5F2Q8N7G0 328 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 BCORP1Q8N888 145 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 PSD4Q8NDX1 1056 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 OR8J3Q8NGG0 315 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 OR5D16Q8NGK9 328 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 OIT3Q8WWZ8 545 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 PIK3R3Q92569 461 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 LRRC58Q96CX6 371 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 RCN3Q96D15 328 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 HHATLQ9HCP6 504 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 POLE3Q9NRF9 147 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 SLAMF8Q9P0V8 285 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 TAGLN3Q9UI15 199 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 K7EM74 188 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 KCNK2O95069 426 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 ATP6V1C1P21283 382 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 CRATP43155 626 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 MVDP53602 400 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 HPCAP84074 193 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 SNTA1Q13424 505 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 LY6DQ14210 128 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 GNA13Q14344 377 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 RGNQ15493 299 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 RUNDC3AQ59EK9 446 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 DCST2Q5T1A1 773 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 SLC22A10Q63ZE4 541 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRK-218ENST00000525459 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms