RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 HSPA12BQ96MM6 686 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 OR51J1Q9H342 316 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SESN1Q9Y6P5 492 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 MYO16Q9Y6X6 1858 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SELENOFO60613 162 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFV2P19404 249 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CNR2P34972 360 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SRP9P49458 86 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 HNMTP50135 292 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 VMACQ2NL98 169 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 GPR33Q49SQ1 333 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 RABEPKQ7Z6M1 372 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 OR4D10Q8NGI6 311 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 OR2T35Q8NGX2 323 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 MAL2Q969L2 176 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 MGME1Q9BQP7 344 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 GLS2Q9UI32 602 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 MYOFQ9NZM1 2061 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ADAMDEC1O15204 470 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 KDM4BO94953 1096 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 LALBAP00709 142 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 OPN1SWP03999 348 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 HNF1BP35680 557 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CSNK1DP48730 415 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 EVX1P49640 407 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CDH12P55289 794 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 RPS25P62851 125 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CBLL1Q75N03 491 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 NANPQ8TBE9 248 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 MRGPRX1Q96LB2 322 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 C7orf66A4D0T2 115 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM229AB2RXF0 380 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 J3KTA2 159 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 GPR171O14626 319 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 TACR1P25103 407 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 BDKRB1P46663 353 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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TRPS1-211ENST00000520276 RPS14P62263 151 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CCINQ13939 588 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 FGL2Q14314 439 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 LRIF1Q5T3J3 769 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 LGI4Q8N135 537 aa9.51□□□□□ -0.89
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TRPS1-211ENST00000520276 TSSK3Q96PN8 268 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 DPYSL5Q9BPU6 564 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ABCG5Q9H222 651 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CTSFQ9UBX1 484 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CD84Q9UIB8 345 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 NEU3Q9UQ49 428 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 RAB19A4D1S5 217 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 GABRR3A8MPY1 467 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 FAM227AF5H4B4 570 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ABCD4O14678 606 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 BPIP17213 487 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ZP1P60852 638 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SERTAD2Q14140 314 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 INSL4Q14641 139 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SIRPB2Q5JXA9 342 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 C9orf64Q5T6V5 341 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 BICRALQ6AI39 1079 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 USP30Q70CQ3 517 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 GPSM1Q86YR5 675 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 OR4K2Q8NGD2 314 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SPPL2AQ8TCT8 520 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 HGDQ93099 445 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 H2AFJQ9BTM1 129 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SAP130Q9H0E3 1048 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 KCNH6Q9H252 994 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFAF4Q9P032 175 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 RPS6KA6Q9UK32 745 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 PPT2Q9UMR5 302 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 EDARQ9UNE0 448 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SGK494L7N484 410 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 SIGLEC6O43699 453 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 KLK8O60259 260 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 ATG12O94817 140 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-211ENST00000520276 APOL3O95236 402 aa9.5□□□□□ -0.89
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