RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506464.5

ABCC3-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, human

TSL 4

Gene ABCC3, Length 540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC3-208	ENST00000506464	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	C3orf30	Q96M34	536 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	COL21A1	Q96P44	957 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	BBS4	Q96RK4	519 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	SORT1	Q99523	831 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	SH3GL2	Q99962	352 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	HHATL	Q9HCP6	504 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	MYNN	Q9NPC7	610 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	C1orf109	Q9NX04	203 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464		Q9UFV3	132 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	HAO1	Q9UJM8	370 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	CD8B2	A6NJW9	211 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ICOSLG	O75144	302 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	SEC22B	O75396	215 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	LRAT	O95237	230 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	IL2RA	P01589	272 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	SDC1	P18827	310 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	TACR1	P25103	407 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	IL12B	P29460	328 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	NTS	P30990	170 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	SOX18	P35713	384 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC1A6	P48664	564 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	TRPC1	P48995	793 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	PNLIPRP2	P54317	469 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	BST1	Q10588	318 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	RCAN2	Q14206	197 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	TOMM20	Q15388	145 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	LTB4R	Q15722	352 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	HHAT	Q5VTY9	493 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	MGARP	Q8TDB4	240 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	VSTM2L	Q96N03	204 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	GNRHR2	Q96P88	292 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	TIMP4	Q99727	224 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	CCT7	Q99832	543 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF559	Q9BR84	538 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	UCK2	Q9BZX2	261 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	CALHM2	Q9HA72	323 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	PLOD2	O00469	737 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	GNB5	O14775	395 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	UGT2B11	O75310	529 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	REM1	O75628	298 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	SASH3	O75995	380 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	CT45A8	P0DMV1	189 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	CT45A9	P0DMV2	189 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	CPN1	P15169	458 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ADH7	P40394	386 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	C2orf80	Q0P641	193 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	STX3	Q13277	289 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	NNAT	Q16517	81 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	GALNTL6	Q49A17	601 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	AAGAB	Q6PD74	315 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	TMBIM1	Q969X1	311 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	EGLN2	Q96KS0	407 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	NODAL	Q96S42	347 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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