RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504431.1

UBE2B-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 235 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-204ENST00000504431 PTPN4P29074 926 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 THBS4P35443 961 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 EFNA3P52797 238 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 PLA2G16P53816 162 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 ARSFP54793 590 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 RPS15P62841 145 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 NCF4Q15080 339 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 RPS6KA2Q15349 733 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 RBBP7Q16576 425 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 BTBD16Q32M84 506 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 COLEC12Q5KU26 742 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
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UBE2B-204ENST00000504431 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.96□□□□□ -1.3
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UBE2B-204ENST00000504431 CCDC91Q7Z6B0 441 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 TDRPQ86YL5 185 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 IQCKQ8N0W5 287 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 MREGQ8N565 214 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 CCNYL1Q8N7R7 359 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 CREB3L4Q8TEY5 395 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 UBTD2Q8WUN7 234 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
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UBE2B-204ENST00000504431 LRFN5Q96NI6 719 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 TMEM237Q96Q45 408 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 F2RL3Q96RI0 385 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 HBEGFQ99075 208 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 MECRQ9BV79 373 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 NLNQ9BYT8 704 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 OR51B5Q9H339 312 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 ACTR8Q9H981 624 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF304Q9HCX3 659 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 TRPC4Q9UBN4 977 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 DCDC2Q9UHG0 476 aa6.96□□□□□ -1.3
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UBE2B-204ENST00000504431 VPS4AQ9UN37 437 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 ARHGAP10A1A4S6 786 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 WDR91A4D1P6 747 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 LRIT2A6NDA9 550 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 ANKDD1BA6NHY2 528 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 ARGFXA6NJG6 315 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 A6NL46 340 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 C9J4A7 227 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 PLIN3O60664 434 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 GLRA3O75311 464 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 OR4F21O95013 312 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 ETHE1O95571 254 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 UMODP07911 640 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 TAC1P20366 129 aa6.95□□□□□ -1.3
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UBE2B-204ENST00000504431 CCT5P48643 541 aa6.95□□□□□ -1.3
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UBE2B-204ENST00000504431 RPS13P62277 151 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
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UBE2B-204ENST00000504431 KLC1Q07866 573 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 CDC20Q12834 499 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 RAPSNQ13702 412 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 LY6DQ14210 128 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 NAA25Q14CX7 972 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 CDKL4Q5MAI5 379 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 MFSD4BQ5TF39 518 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 MED27Q6P2C8 311 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 SCIMPQ6UWF3 145 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 SYVN1Q86TM6 617 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 EXOC3L1Q86VI1 746 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 C10orf107Q8IVU9 208 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 BANPQ8N9N5 519 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 CAMKVQ8NCB2 501 aa6.95□□□□□ -1.3
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UBE2B-204ENST00000504431 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
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UBE2B-204ENST00000504431 OR4F6Q8NGB9 312 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 OR51Q1Q8NH59 317 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 HUS1BQ8NHY5 278 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 TCP10LQ8TDR4 215 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 ACMSDQ8TDX5 336 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 PPP4R1Q8TF05 950 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 NPIPB3Q92617 1050 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 C8orf44Q96CB5 159 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 SLC45A3Q96JT2 553 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 FAM111AQ96PZ2 611 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 KCNA7Q96RP8 456 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 C17orf62Q9BQA9 187 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-204ENST00000504431 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
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