RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
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SH3BP2-208ENST00000504294 ASF1BQ9NVP2 202 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 ABCG2Q9UNQ0 655 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 DTX4Q9Y2E6 619 aa13.38□□□□□ -0.27
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SH3BP2-208ENST00000504294 KLRF1Q9NZS2 232 aa13.37□□□□□ -0.27
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SH3BP2-208ENST00000504294 C6orf10Q5SRN2 563 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 NPSR1Q6W5P4 371 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 CPLX4Q7Z7G2 160 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 ANKRD46Q86W74 232 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC16A11Q8NCK7 471 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 OR1J4Q8NGS1 313 aa13.35□□□□□ -0.27
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SH3BP2-208ENST00000504294 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
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