RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
HOXB3-211ENST00000490677 FAM221AA4D161 298 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 UPK1AO00322 258 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 DVL2O14641 736 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 PSPHP78330 225 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 EFR3AQ14156 821 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 IMPG1Q17R60 797 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 LIPMQ5VYY2 423 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 OR2L13Q8N349 312 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 C9orf106Q8NAJ2 232 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 OR2T11Q8NH01 316 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 NRGNQ92686 78 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 AMDHD1Q96NU7 426 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 TUBA1CQ9BQE3 449 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 TUBB1Q9H4B7 451 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 COPEO14579 308 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 CTAG2O75638 210 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 SLITRK5O94991 958 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 IL2RAP01589 272 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 CYP4B1P13584 511 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 SRD5A2P31213 254 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 CFAP157Q5JU67 520 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM107Q6UX40 140 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 SPNS3Q6ZMD2 512 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 RNF165Q6ZSG1 346 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 Q6ZSR9 355 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 IKBIPQ70UQ0 350 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 C10orf107Q8IVU9 208 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 TRIM42Q8IWZ5 723 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 ZZZ3Q8IYH5 903 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 MIEF1Q9NQG6 463 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 JKAMPQ9P055 326 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 ABCA4P78363 2273 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 ITPR3Q14573 2671 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 ZIC3O60481 467 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 GRK2P25098 689 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 LHX2P50458 406 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 OR5M10Q6IEU7 315 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM200AQ86VY9 491 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 OR14L1PQ8NHC6 308 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 ELP4Q96EB1 424 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 UCN2Q96RP3 112 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 RTN4RQ9BZR6 473 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 MKS1Q9NXB0 559 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 TAS2R10Q9NYW0 307 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 FLRT3Q9NZU0 649 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 CRIM1Q9NZV1 1036 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 SENP1Q9P0U3 644 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 FADS1O60427 444 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 COQ9O75208 318 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 IL12BP29460 328 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 UQCRC1P31930 480 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 CLDN18P56856 261 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 B3GALT5-AS1P59052 145 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 PLXDC2Q6UX71 529 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 IFNEQ86WN2 208 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 FADS6Q8N9I5 356 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 OR2W6PQ8NHA6 318 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.632e-8■■■■■ 72.2
HOXB3-211ENST00000490677 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 CLCF1Q9UBD9 225 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 CRCPO75575 148 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 IFI6P09912 130 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 CTSSP25774 331 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 KIR2DL3P43628 341 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 STARP49675 285 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 FOXF2Q12947 444 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 GAB1Q13480 694 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 AZIN1O14977 448 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 SEC22BO75396 215 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 ZWINTO95229 277 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 IL18BPO95998 194 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 EVI2BP34910 448 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 MAP3K8P41279 467 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 CYP27C1Q4G0S4 372 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF385BQ569K4 471 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 KANK2Q63ZY3 851 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 BANPQ8N9N5 519 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC63Q8NA47 563 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 C1orf109Q9NX04 203 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 OR10H1Q9Y4A9 318 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF708P17019 499 aa25.2■■□□□ 1.62
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