RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490205.1

NELFCD-210, Transcript of negative elongation factor complex member C/D, humanhuman

TSL 2

Gene NELFCD, Length 650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCD-210ENST00000490205 ARL10Q8N8L6 244 aa2.46□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 RFESDQ8TAC1 157 aa2.46□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 VN1R17PQ8TDU5 208 aa2.46□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 SLC25A36Q96CQ1 311 aa2.46□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 VSIG2Q96IQ7 327 aa2.46□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 NSMCE2Q96MF7 247 aa2.46□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 TM2D1Q9BX74 207 aa2.46□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 DEFB126Q9BYW3 111 aa2.46□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 HSD3B7Q9H2F3 369 aa2.46□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 SOHLH2Q9NX45 425 aa2.46□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 IMPAD1Q9NX62 359 aa2.46□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 MOSPD1Q9UJG1 213 aa2.46□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 CCPG1Q9ULG6 757 aa2.46□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 PLA2G4CQ9UP65 541 aa2.46□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 GPRASP1Q5JY77 1395 aa2.46□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 EFCAB7A8K855 629 aa2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 CFLARO15519 480 aa2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 SEC22BO75396 215 aa2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 SLC2A10O95528 541 aa2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 CT45A10P0DMU9 189 aa2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 MGMTP16455 207 aa2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 STMN1P16949 149 aa2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 PTPN6P29350 595 aa2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 RPL34P49207 117 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 GPC3P51654 580 aa2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 NME3Q13232 169 aa2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 CEBPEQ15744 281 aa2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 LEG1Q6P5S2 330 aa2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 SLC39A4Q6P5W5 647 aa2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 MIER3Q7Z3K6 550 aa2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 GPR65Q8IYL9 337 aa2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 PRR22Q8IZ63 422 aa2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 OR8H1Q8NGG4 311 aa2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 OR56B1Q8NGI3 324 aa2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 BADQ92934 168 aa2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 C9orf85Q96MD7 179 aa2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 TIGARQ9NQ88 270 aa2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 NTNG1Q9Y2I2 539 aa2.45□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 UBE4BO95155 1302 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 A8MX80 341 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 SLC17A2O00624 439 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 TM9SF1O15321 606 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 LANCL1O43813 399 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 NDUFA7O95182 113 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 PRAMEF12O95522 483 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 KRT6AP02538 564 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 KRT6BP04259 564 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 GAP43P17677 238 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 GDF1P27539 372 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 MAGEA9P43362 315 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 KRT6CP48668 564 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 CAMLGP49069 296 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 MEOX2P50222 304 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 SLC26A5P58743 744 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 RPS6P62753 249 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 IL1RL1Q01638 556 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 SNX1Q13596 522 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 PARP6Q2NL67 630 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 CCDC40Q4G0X9 1142 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 PARP10Q53GL7 1025 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 KDM8Q8N371 416 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 TSPAN18Q96SJ8 248 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 PAXXQ9BUH6 204 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 HCAR1Q9BXC0 346 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 TEX13BQ9BXU2 312 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 TMEM231Q9H6L2 316 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 PDFQ9HBH1 243 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 MIEF1Q9NQG6 463 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 P2RX2Q9UBL9 471 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 DUSP12Q9UNI6 340 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 MOKQ9UQ07 419 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 FKBP7Q9Y680 259 aa2.44□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 NPIPA2E9PIF3 369 aa2.43□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 E9PMD0 336 aa2.43□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 C11orf98E9PRG8 122 aa2.43□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 G3V3Y1 287 aa2.43□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 SGK494L7N484 410 aa2.43□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 ALOX15BO15296 676 aa2.43□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
NELFCD-210ENST00000490205 APBB3O95704 486 aa2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms