RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF6	Q9Y252	685 aa		15.83	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	15.83	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		15.82	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJC13	O75165	2243 aa		15.82	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		15.82	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A087WV62	115 aa		15.82	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	TBX19	O60806	448 aa		15.82	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	LRAT	O95237	230 aa		15.82	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		15.82	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	PRF1	P14222	555 aa		15.82	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	TACR1	P25103	407 aa		15.82	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	PEX19	P40855	299 aa		15.82	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	EMD	P50402	254 aa		15.82	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	15.82	■□□□□ 0.12	8e-8	■□□□□ 8.9
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		15.82	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		15.82	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		15.82	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		15.82	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		15.82	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		15.82	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		15.82	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	EGLN2	Q96KS0	407 aa		15.82	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	RILP	Q96NA2	401 aa		15.82	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		15.82	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		15.82	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ASIC5	Q9NY37	505 aa		15.82	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		15.82	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	TTC36	A6NLP5	189 aa		15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	PLOD2	O00469	737 aa		15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	PDPK1	O15530	556 aa		15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	GPC1	P35052	558 aa		15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	KIR3DL1	P43629	444 aa		15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	NUP107	P57740	925 aa		15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXW4	P57775	412 aa		15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	TFF3	Q07654	80 aa		15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	PMPCA	Q10713	525 aa		15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CDSN	Q15517	529 aa		15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CPTP	Q5TA50	214 aa		15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	HGD	Q93099	445 aa		15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	TMCO6	Q96DC7	493 aa		15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC35A4	Q96G79	324 aa		15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		15.81	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CBR3	O75828	277 aa		15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	TOX	O94900	526 aa		15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CELA3A	P09093	270 aa		15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	GLI4	P10075	376 aa		15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	G6PD	P11413	515 aa		15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CLDN8	P56748	225 aa		15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	EFR3A	Q14156	821 aa		15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	VASN	Q6EMK4	673 aa		15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	RTL6	Q6ICC9	239 aa		15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	OGFOD2	Q6N063	350 aa		15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	DOK4	Q8TEW6	326 aa		15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ITPA	Q9BY32	194 aa		15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	DPY30	Q9C005	99 aa		15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	EXO5	Q9H790	373 aa		15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		15.8	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	HSPB2	A8KAH6	182 aa		15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	SDHD	O14521	159 aa		15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	DIAPH2	O60879	1101 aa		15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	EPPIN	O95925	133 aa		15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	GDF1	P27539	372 aa		15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	MSX1	P28360	303 aa		15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	EPHA3	P29320	983 aa		15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	TIMP3	P35625	211 aa		15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	MASP1	P48740	699 aa		15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	PNLIPRP2	P54317	469 aa		15.79	■□□□□ 0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		15.79	■□□□□ 0.12

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