RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	RHCE	P18577	417 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	MAG	P20916	626 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	IGFBP5	P24593	272 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CERS1	P27544	350 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CD38	P28907	300 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	TTK	P33981	857 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	MPI	P34949	423 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SOAT1	P35610	550 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	PIGA	P37287	484 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	GABRA4	P48169	554 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	KHK	P50053	298 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	DAP	P51397	102 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ARHGDIA	P52565	204 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	NXPH1	P58417	271 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ISL1	P61371	349 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	HHEX	Q03014	270 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SPIDR	Q14159	915 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	NR1D2	Q14995	579 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF691	Q5VV52	312 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	MLIP	Q5VWP3	458 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	KLHL35	Q6PF15	583 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ABHD13	Q7L211	337 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	OOSP2	Q86WS3	158 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2L13	Q8N349	312 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	BBS10	Q8TAM1	723 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF675	Q8TD23	568 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CYGB	Q8WWM9	190 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	PATE1	Q8WXA2	126 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	PMM1	Q92871	262 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	FKBP10	Q96AY3	582 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	GIMAP5	Q96F15	307 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM19	Q96HH6	336 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	MUS81	Q96NY9	551 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	BBS4	Q96RK4	519 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CD180	Q99467	661 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	PIP5K1A	Q99755	562 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	FUZ	Q9BT04	418 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	REEP1	Q9H902	201 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	EXD2	Q9NVH0	621 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	GIN1	Q9NXP7	522 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CA14	Q9ULX7	337 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	DAPP1	Q9UN19	280 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	LIPT1	Q9Y234	373 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	REV3L	O60673	3130 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	NUMA1	Q14980	2115 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A0G2JPF8	293 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1B0GTW7	788 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247		H0YGG7	62 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CYR61	O00622	381 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SCAMP1	O15126	338 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	B3GALT2	O43825	422 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	PLOD3	O60568	738 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	PRAMEF10	O60809	474 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SERPINB7	O75635	380 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	SOX30	O94993	753 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP1B1	P05026	303 aa		5.18	□□□□□ -1.58

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