RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 FBXO42Q6P3S6 717 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 AHSA2Q719I0 299 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 GALNT15Q8N3T1 639 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 OR6K6Q8NGW6 343 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 SGTBQ96EQ0 304 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 ARMC1Q9NVT9 282 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 WWP2O00308 870 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 HPRP00739 348 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 PNMTP11086 282 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 IL12AP29459 219 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 CDKN2CP42773 168 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 MYBPC1Q00872 1141 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM225Q6GV28 225 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 SPRED1Q7Z699 444 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 PIK3R3Q92569 461 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 TEX37Q96LM6 180 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 TAAR9Q96RI9 348 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 GRHPRQ9UBQ7 328 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 ANKRD12Q6UB98 2062 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 GJE1A6NN92 205 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 MEN1O00255 615 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 PLD2O14939 933 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 RRP8O43159 456 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 LILRB5O75023 590 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 MT-CO3P00414 261 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 IGLV3-19P01714 112 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 APOA1P02647 267 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 C7P10643 843 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 GPX2P18283 190 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 TALDO1P37837 337 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 PCDH1Q08174 1060 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 CD47Q08722 323 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 MFSD13AQ14CX5 517 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 TLR1Q15399 786 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 INAQ16352 499 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 CCNJQ5T5M9 372 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 MFSD12Q6NUT3 480 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 RNFT2Q96EX2 444 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 RBP7Q96R05 134 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 FOLH1BQ9HBA9 442 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 VWA8A3KMH1 1905 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 A6NL46 340 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 SP9P0CG40 484 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 DCTP40126 519 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 LAPTM4AQ15012 233 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 CBLL1Q75N03 491 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 OR6N1Q8NGY5 312 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 C16orf58Q96GQ5 468 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 SLC41A3Q96GZ6 507 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 MPP4Q96JB8 637 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 NODALQ96S42 347 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 TOR4AQ9NXH8 423 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 ANKRD28O15084 1053 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 RNF13O43567 381 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 FGF17O60258 216 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 TNFSF15O95150 251 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 BCL10O95999 233 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 ATP12AP54707 1039 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 KCNJ10P78508 379 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 CBFBQ13951 182 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 PON3Q15166 354 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 LRIF1Q5T3J3 769 aa7.74□□□□□ -1.17
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PTPRD-211ENST00000486161 OR14L1PQ8NHC6 308 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 FANK1Q8TC84 345 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF583Q96ND8 569 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 OR2A5Q96R48 311 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 IL4I1Q96RQ9 567 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 S100A13Q99584 98 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 TWSG1Q9GZX9 223 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 SMURF2Q9HAU4 748 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 NANSQ9NR45 359 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 POLE3Q9NRF9 147 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 RIMS3Q9UJD0 308 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 SH2B3Q9UQQ2 575 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 SERTM1A2A2V5 107 aa7.73□□□□□ -1.17
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