RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 MAVSQ7Z434 540 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 VWA5B2Q8N398 1253 aa11.52□□□□□ -0.57
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PRAME-212ENST00000485532 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
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PRAME-212ENST00000485532 USH1CQ9Y6N9 552 aa11.51□□□□□ -0.57
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PRAME-212ENST00000485532 C17orf51A8MQB3 221 aa11.5□□□□□ -0.57
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PRAME-212ENST00000485532 UGT2B11O75310 529 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 CRCPO75575 148 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 FAM107AO95990 144 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 ATP1B1P05026 303 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 UROSP10746 265 aa11.5□□□□□ -0.57
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PRAME-212ENST00000485532 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
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PRAME-212ENST00000485532 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
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PRAME-212ENST00000485532 CXXC4Q9H2H0 198 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-212ENST00000485532 TUBB1Q9H4B7 451 aa11.5□□□□□ -0.57
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PRAME-212ENST00000485532 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP11.5□□□□□ -0.57
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