RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477563.6

RBBP4-211, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-211ENST00000477563 A0A1W2PR48 441 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 GOLGA6L10A6NI86 522 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 CAPN14A8MX76 684 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 A8MXE2 369 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 HRKO00198 91 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 MANBAO00462 879 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 ERN1O75460 977 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 CRLF1O75462 422 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 EEDO75530 441 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 AIFM1O95831 613 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 ACTL6AO96019 429 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 PDYNP01213 254 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 CLPSP04118 112 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 ATP1B1P05026 303 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 NEFHP12036 1026 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 CPA3P15088 417 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 FPR1P21462 350 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 HMOX2P30519 316 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 GPC1P35052 558 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 SOX18P35713 384 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 MC3RP41968 323 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 MAPK12P53778 367 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 CDH13P55290 713 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 PPP2R2BQ00005 443 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 IFFO1Q0D2I5 559 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 HEPACAMQ14CZ8 416 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 EBPQ15125 230 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 ACKR1Q16570 336 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 SLC48A1Q6P1K1 146 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 KIRREL3Q8IZU9 778 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 BANPQ8N9N5 519 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 OR7G1Q8NGA0 311 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 METTL6Q8TCB7 284 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 SPPL2AQ8TCT8 520 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 TMEM41AQ96HV5 264 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 MARK4Q96L34 752 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 TRIB1Q96RU8 372 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 CCT7Q99832 543 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 GSX2Q9BZM3 304 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 WWTR1Q9GZV5 400 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 PIGMQ9H3S5 423 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 GALNT8Q9NY28 637 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 NDRG3Q9UGV2 375 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 PSME2Q9UL46 239 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 SLC12A4Q9UP95 1085 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 CAMK2AQ9UQM7 478 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 CFL2Q9Y281 166 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 C15orf41Q9Y2V0 281 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 PLLPQ9Y342 182 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.96□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 A0A1W2PPM1 405 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 GOLGA8RI6L899 631 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 SAP18O00422 153 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 TP53I11O14683 189 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 CTIFO43310 598 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 NPHS1O60500 1241 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 TMCC2O75069 709 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 SOX30O94993 753 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 OR4F21O95013 312 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 UROSP10746 265 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 CRYGSP22914 178 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 PIK3R1P27986 724 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 PTPN6P29350 595 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 CASP3P42574 277 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 SLCO1A2P46721 670 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 TMED10P49755 219 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 NEK2P51955 445 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 NAGLUP54802 743 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 ACSM2AQ08AH3 577 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 FUT7Q11130 342 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 FOXF2Q12947 444 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 GAB1Q13480 694 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 RCAN2Q14206 197 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 PCLAFQ15004 111 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 POU4F3Q15319 338 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 RPS6KA2Q15349 733 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 CFAP157Q5JU67 520 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 DCST1Q5T197 706 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 SCIMPQ6UWF3 145 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.95□□□□□ -1.3
RBBP4-211ENST00000477563 IKBIPQ70UQ0 350 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms