RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470965.1

HDAC10-208, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 810 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-208	ENST00000470965	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	HS6ST1	O60243	411 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	UNC5C	O95185	931 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	IL33	O95760	270 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	ALOX5	P09917	674 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	IL12A	P29459	219 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	GABRA3	P34903	492 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	UQCRFS1	P47985	274 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	NME5	P56597	212 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	PHC1	P78364	1004 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	TP53BP2	Q13625	1128 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	CDC73	Q6P1J9	531 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	PAOX	Q6QHF9	649 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	GPR151	Q8TDV0	419 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	SLC9A6	Q92581	669 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	RILP	Q96NA2	401 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	CCDC115	Q96NT0	180 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	EBF4	Q9BQW3	602 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	NBAS	A2RRP1	2371 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	DYNC1I1	O14576	645 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	LCN1	P31025	176 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	SOAT1	P35610	550 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	RFC3	P40938	356 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	RNF138	Q8WVD3	245 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	OR52E6	Q96RD3	313 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	NODAL	Q96S42	347 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	PIGU	Q9H490	435 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-208	ENST00000470965	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	ACP2	P11117	423 aa		18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	UQCRC2	P22695	453 aa		18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	MASP1	P48740	699 aa		18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	ATP4B	P51164	291 aa		18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	JADE3	Q92613	823 aa		18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	MARK4	Q96L34	752 aa		18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	FAM234B	A2RU67	622 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	DUXA	A6NLW8	204 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	FAM166B	A8MTA8	275 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	ICOSLG	O75144	302 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	IGHG3	P01860	377 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	STS	P08842	583 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	CYP4B1	P13584	511 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	DGKQ	P52824	942 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	DUSP5	Q16690	384 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	ANKRD46	Q86W74	232 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	COX18	Q8N8Q8	333 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	PRR7	Q8TB68	274 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	FAM110B	Q8TC76	370 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	PIK3R3	Q92569	461 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-208	ENST00000470965	BTBD2	Q9BX70	525 aa		18.25	■□□□□ 0.51

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