RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468468.5

TSPAN4-211, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 2,777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-211ENST00000468468 B4DXG7 233 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 PGRMC2O15173 223 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 CD79BP40259 229 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 P2RY2P41231 377 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 SLC9A5Q14940 896 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 MINDY4Q4G0A6 757 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ZNF730Q6ZMV8 503 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 LHFPL3Q86UP9 236 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 RDH10Q8IZV5 341 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 VWA5B2Q8N398 1253 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 SLC38A2Q96QD8 506 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ISYNA1Q9NPH2 558 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 COMMD3Q9UBI1 195 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 CASC3O15234 703 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 FRS3O43559 492 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 UBXN7O94888 489 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ALX3O95076 343 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 NTN1O95631 604 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 LIMS3P0CW19 117 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 LIMS4P0CW20 117 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 TRAPPC2P0DI81 140 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 TRAPPC2BP0DI82 140 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 C8orf89P0DMQ9 161 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 GNA13Q14344 377 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 CDK10Q15131 360 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 SHHQ15465 462 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 FAM214AQ32MH5 1076 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ZNF628Q5EBL2 1059 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 VITQ6UXI7 678 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 SLC7A6Q92536 515 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa14.82□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 PLA2G10O15496 165 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 SEC14L5O43304 696 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 MYL9P24844 172 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 GABRA5P31644 462 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 GALK2Q01415 458 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 DUSP2Q05923 314 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ZNF311Q5JNZ3 666 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 BHLHB9Q6PI77 547 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 OR8K5Q8NH50 307 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 FRMD6Q96NE9 622 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 PLSCR3Q9NRY6 295 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 IGLON5A6NGN9 336 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 CASKO14936 926 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 SOX18P35713 384 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 IFNGR2P38484 337 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 WASP42768 502 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 KIR2DL3P43628 341 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 HOXC5Q00444 222 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 TMEM107Q6UX40 140 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 TMEM64Q6YI46 380 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 RRM2BQ7LG56 351 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 MRGPREQ86SM8 312 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 RAB42Q8N4Z0 105 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 UBASH3BQ8TF42 649 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 C12orf66Q96MD2 445 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 RNF121Q9H920 327 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 SEMA4GQ9NTN9 838 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 SLC13A4Q9UKG4 626 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa14.81□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 A0A1W2PR48 441 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 C4orf51C9J302 202 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 CH25HO95992 272 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 APEX1P27695 318 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 TSPAN31Q12999 210 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 TRAM2Q15035 370 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 VRK2Q86Y07 508 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 SUSD6Q92537 303 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 KLK6Q92876 244 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ZG16BQ96DA0 208 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 CAMK1GQ96NX5 476 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 TMEM246Q9BRR3 403 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 EQTNQ9NQ60 294 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 CLCA2Q9UQC9 943 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ATG4BQ9Y4P1 393 aa14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TSPAN4-211ENST00000468468 A0A1W2PS29 197 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms