RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410466.1

RNU6-554P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 554, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-554P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-554P-201ENST00000410466 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 PREBQ9HCU5 417 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 TMEM106BQ9NUM4 274 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 A6NLC8 198 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZNF850A8MQ14 1090 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 SLC28A1O00337 649 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 OR10H3O60404 316 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 SRP72O76094 671 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 THRBP10828 461 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 GHRP10912 638 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 LAMP2P13473 410 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 SRD5A2P31213 254 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 TUBP50607 506 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZNF85Q03923 595 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZNF235Q14590 738 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 IHHQ14623 411 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 AANATQ16613 207 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 TSTQ16762 297 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 C1orf189Q5VU69 101 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 C1orf94Q6P1W5 598 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 KBTBD6Q86V97 674 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 ESX1Q8N693 406 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 RFFLQ8WZ73 363 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 TAAR1Q96RJ0 339 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 ABCG8Q9H221 673 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZNF442Q9H7R0 627 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZNF665Q9H7R5 613 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 GNPTGQ9UJJ9 305 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 FN1P02751 2386 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 DOCK10Q96BY6 2186 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 CCDC88CQ9P219 2028 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 MUC21A0A140T8X8 626 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 PRC1O43663 620 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 MOSP00540 346 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 PCGF2P35227 344 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 ARL3P36405 182 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 NMUP48645 174 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 PITPNAQ00169 270 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 MORC3Q14149 939 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 IRF3Q14653 427 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 PTPRCAPQ14761 206 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 FAM120AOSQ5T036 256 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 KLHL10Q6JEL2 608 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 SPINT4Q6UDR6 99 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 FAM220AQ7Z4H9 259 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 TLK2Q86UE8 772 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 CSNK1A1LQ8N752 337 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 TSPAN14Q8NG11 270 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZNF502Q8TBZ5 544 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 OR1E3Q8WZA6 343 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 PCED1BQ96HM7 432 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 TSSK2Q96PF2 358 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 WASH6PQ9NQA3 447 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 VPS18Q9P253 973 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZNF222Q9UK12 451 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 A0A1W2PPW3 197 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 CCDC162PA2VCL2 907 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 YJEFN3A6XGL0 299 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 C11orf98E9PRG8 122 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 HCN1O60741 890 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 CLN5O75503 358 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 IGLL1P15814 213 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 UBXN1Q04323 297 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZNF616Q08AN1 781 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZNF154Q13106 437 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 GRB7Q14451 532 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 IL11RAQ14626 422 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 CAMK4Q16566 473 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 CFAP221Q4G0U5 840 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 C6orf163Q5TEZ5 329 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 WDR78Q5VTH9 848 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 RHBDD2Q6NTF9 364 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 C6orf89Q6UWU4 347 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 ENPP7Q6UWV6 458 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 Q6ZRG5 221 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-554P-201ENST00000410466 ZNF567Q8N184 647 aa-0.76□□□□□ -2.53
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