RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409937.1

CNGA3-204, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CNGA3, Length 2,615 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-204ENST00000409937 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 NTSP30990 170 aa13.21□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 SLC1A3P43003 542 aa13.21□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 EPHA5P54756 1037 aa13.21□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 SMIM11AP58511 58 aa13.21□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 LRRC32Q14392 662 aa13.21□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 NDUFA5Q16718 116 aa13.21□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 TATDN3Q17R31 274 aa13.21□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 WSCD2Q2TBF2 565 aa13.21□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF628Q5EBL2 1059 aa13.21□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 C3orf38Q5JPI3 329 aa13.21□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 SYCE2Q6PIF2 218 aa13.21□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 FAM92BQ6ZTR7 304 aa13.21□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 KLBQ86Z14 1044 aa13.21□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 FBXL6Q8N531 539 aa13.21□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 CLDN22Q8N7P3 220 aa13.21□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 FAM181AQ8N9Y4 354 aa13.21□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 SNX18Q96RF0 628 aa13.21□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 MCOLN1Q9GZU1 580 aa13.21□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 TMEM245Q9H330 911 aa13.21□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 SERGEFQ9UGK8 458 aa13.21□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 ALG5Q9Y673 324 aa13.21□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 FGBP02675 491 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 IL12RB1P42701 662 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 BNC1Q01954 994 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 CAMK1Q14012 370 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 QPRTQ15274 297 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 FAM27D1Q5T7N8 215 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 HSDL2Q6YN16 418 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 NOXA1Q86UR1 476 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 NRMQ8IXM6 262 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 RDH10Q8IZV5 341 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 POF1BQ8WVV4 589 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 COL26A1Q96A83 441 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 UPRTQ96BW1 309 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 OR7D2Q96RA2 312 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 INSL6Q9Y581 213 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 AKR7A2O43488 359 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 VEGFDO43915 354 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 CLTBP09497 229 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 ERGP11308 486 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 CTNNB1P35222 781 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 ENTPD8Q5MY95 495 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 TRIQKQ629K1 86 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 VASNQ6EMK4 673 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 NR2C2APQ86WQ0 139 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 YIPF7Q8N8F6 280 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 TMEM145Q8NBT3 493 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 RASSF5Q8WWW0 418 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 ATF6BQ99941 703 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 GDF15Q99988 308 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 TTTY10Q9BZA0 68 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 SLC38A1Q9H2H9 487 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 SPHK1Q9NYA1 384 aa13.2□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 CDC42EP2O14613 210 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 ATP6V1E1P36543 226 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 PDX1P52945 283 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 DPTQ07507 201 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 EFR3AQ14156 821 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 KLHL22Q53GT1 634 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 CCNJQ5T5M9 372 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 METRNLQ641Q3 311 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 FCRLBQ6BAA4 426 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 SMARCD3Q6STE5 483 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 OR4N5Q8IXE1 308 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 CADM2Q8N3J6 435 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 SIRT6Q8N6T7 355 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 OR51G2Q8NGK0 314 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 OR2A1Q8NGT9 310 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 NEIL3Q8TAT5 605 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 COX14Q96I36 57 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 WACQ9BTA9 647 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 CFHR5Q9BXR6 569 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 RNF32Q9H0A6 362 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 GALNT9Q9HCQ5 603 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 SLC6A20Q9NP91 592 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 MAU2Q9Y6X3 613 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 GABRPO00591 440 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 DDX5P17844 614 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 TBXA2RP21731 343 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 MAP2K3P46734 347 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 GALK2Q01415 458 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 RAB40BQ12829 278 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 COX10Q12887 443 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 TPBGQ13641 420 aa13.19□□□□□ -0.3
CNGA3-204ENST00000409937 MINDY4Q4G0A6 757 aa13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms