RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380232.3

IFNB1-201, Transcript of interferon beta 1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IFNB1, Length 859 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1-201ENST00000380232 SLC18A2Q05940 514 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 FOXM1Q08050 763 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 LCP2Q13094 533 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 NAE1Q13564 534 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 GRB7Q14451 532 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 CASP8Q14790 479 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 TMEM35AQ53FP2 167 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 ALG10Q5BKT4 473 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 ALG10BQ5I7T1 473 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 CFAP157Q5JU67 520 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 CEP85LQ5SZL2 805 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 AGBL2Q5U5Z8 902 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 RHBDD2Q6NTF9 364 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 MED27Q6P2C8 311 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 FIGLAQ6QHK4 219 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 RNF165Q6ZSG1 346 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 FAM92BQ6ZTR7 304 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 ADCK2Q7Z695 626 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 CMC1Q7Z7K0 106 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 TMEM126BQ8IUX1 230 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 LRRC34Q8IZ02 419 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 FAM9CQ8IZT9 166 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 IQCKQ8N0W5 287 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 BMPERQ8N8U9 685 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 CCDC63Q8NA47 563 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 LINC01555Q8NAE3 123 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 OR4K1Q8NGD4 311 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 L3HYPDHQ96EM0 354 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 ZNF285Q96NJ3 590 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 QRFPRQ96P65 431 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 OR6C1Q96RD1 312 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 DPH7Q9BTV6 452 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 NTMT1Q9BV86 223 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 ALG9Q9H6U8 611 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 CAB39LQ9H9S4 337 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 ZNF304Q9HCX3 659 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 MED4Q9NPJ6 270 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 ABCF3Q9NUQ8 709 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 MS4A12Q9NXJ0 267 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 AHSPQ9NZD4 102 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 PISDQ9UG56 409 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 SNX6Q9UNH7 406 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 SATB2Q9UPW6 733 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 SLC22A7Q9Y694 548 aa5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 PTPRBP23467 1997 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 A0A1W2PPV9 198 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 GAGE12JA6NER3 117 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 PRSS44E7EML9 344 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 H0YIV9 168 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 MAP2K7O14733 419 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 SEMA3DO95025 777 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 CLDN9O95484 217 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 KRT6AP02538 564 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 KRT6BP04259 564 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 LCKP06239 509 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 SERPINA6P08185 405 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 RPS17P08708 135 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 NEFHP12036 1026 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 IMPDH1P20839 514 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 JAK1P23458 1154 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 PPP2R1BP30154 601 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 ALDH3A1P30838 453 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 KRT6CP48668 564 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 CCNG1P51959 295 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 GFERP55789 205 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 RPS15P62841 145 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 REEP5Q00765 189 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 IFT88Q13099 833 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 GTF2H2Q13888 395 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 C16orf72Q14CZ0 275 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 PHKG1Q16816 387 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 PFKFB4Q16877 469 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 BTBD16Q32M84 506 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 NKAIN2Q5VXU1 208 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 TRIM40Q6P9F5 258 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 ZYG11AQ6WRX3 759 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 Q6ZTK2 550 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 TRILQ7L0X0 811 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 PAGE2Q7Z2X7 111 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 TMPRSS11BQ86T26 416 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 ASPGQ86U10 573 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 PAQR7Q86WK9 346 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 HPS6Q86YV9 775 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 KLBQ86Z14 1044 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 DNAJC22Q8N4W6 341 aa5.75□□□□□ -1.49
IFNB1-201ENST00000380232 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms