RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371219.2

RBM38-204, Transcript of RNA binding motif protein 38, human

TSL 2 BASIC

Gene RBM38, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM38-204	ENST00000371219	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	COX18	Q8N8Q8	333 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	DIO2	Q92813	273 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	COL21A1	Q96P44	957 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	SVIL	O95425	2214 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ASPDH	A6ND91	283 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	DCTN3	O75935	186 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ANP32D	O95626	131 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	IL33	O95760	270 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219		P04436	131 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	NGFR	P08138	427 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ACP2	P11117	423 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	NFATC3	Q12968	1075 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	KLF10	Q13118	480 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	FADD	Q13158	208 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	NNAT	Q16517	81 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	DUSP5	Q16690	384 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	NADK2	Q4G0N4	442 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	SPINK14	Q6IE38	97 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	GK5	Q6ZS86	529 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219		Q8NA96	180 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	FAM13C	Q8NE31	585 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	GPR151	Q8TDV0	419 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ZFP90	Q8TF47	636 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	RNF138	Q8WVD3	245 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	SLC9A6	Q92581	669 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	JADE3	Q92613	823 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	TMBIM1	Q969X1	311 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	TMCO6	Q96DC7	493 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	INPP5K	Q9BT40	448 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	HS6ST1	O60243	411 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	MATN1	P21941	496 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	GABRA3	P34903	492 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	CDKN2C	P42773	168 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	STX5	Q13190	355 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	BCORP1	Q8N888	145 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	FAM110B	Q8TC76	370 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	POLE3	Q9NRF9	147 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	EXD2	Q9NVH0	621 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	MAP10	Q9P2G4	905 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	SUV39H1	O43463	412 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	KCNK2	O95069	426 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	SNX4	O95219	450 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	RASAL1	O95294	804 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	F10	P00742	488 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	FBXW4	P57775	412 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	MDGA2	Q7Z553	956 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	PMM1	Q92871	262 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	HGD	Q93099	445 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	NTNG2	Q96CW9	530 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	OR7D2	Q96RA2	312 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	MFRP	Q9BY79	579 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM38-204	ENST00000371219	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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