RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 GGT1P19440 569 aa27.35■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 PPICP45877 212 aa27.35■■□□□ 1.97
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ECHS1-201ENST00000368547 MVDP53602 400 aa27.35■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 PSG6Q00889 435 aa27.35■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 COX20Q5RI15 118 aa27.35■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.979e-7■■■□□ 15.5
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ECHS1-201ENST00000368547 ERICH5Q6P6B1 374 aa27.35■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 MICU2Q8IYU8 434 aa27.35■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF441Q8N8Z8 693 aa27.35■■□□□ 1.97
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ECHS1-201ENST00000368547 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 BTBD9Q96Q07 612 aa27.35■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 MYOTQ9UBF9 498 aa27.35■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
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ECHS1-201ENST00000368547 CT45A9P0DMV2 189 aa27.34■■□□□ 1.97
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ECHS1-201ENST00000368547 FADDQ13158 208 aa27.34■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 CT45A2Q5DJT8 189 aa27.34■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 MTX3Q5HYI7 312 aa27.34■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa27.34■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
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ECHS1-201ENST00000368547 MIPOL1Q8TD10 442 aa27.34■■□□□ 1.97
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ECHS1-201ENST00000368547 ATP6V1B2P21281 511 aa27.34■■□□□ 1.97
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ECHS1-201ENST00000368547 MAN2A2P49641 1150 aa27.34■■□□□ 1.97
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ECHS1-201ENST00000368547 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
ECHS1-201ENST00000368547 C17orf47Q8NEP4 570 aa27.34■■□□□ 1.97
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ECHS1-201ENST00000368547 CDCP1Q9H5V8 836 aa27.34■■□□□ 1.97
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ECHS1-201ENST00000368547 H0Y3Z8 333 aa27.32■■□□□ 1.96
ECHS1-201ENST00000368547 MAN1A2O60476 641 aa27.32■■□□□ 1.96
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ECHS1-201ENST00000368547 CYP2R1Q6VVX0 501 aa27.32■■□□□ 1.96
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ECHS1-201ENST00000368547 C10orf111Q8N326 155 aa27.32■■□□□ 1.96
ECHS1-201ENST00000368547 PYDC1Q8WXC3 89 aa27.32■■□□□ 1.96
ECHS1-201ENST00000368547 SLC35A4Q96G79 324 aa27.32■■□□□ 1.96
ECHS1-201ENST00000368547 GPR83Q9NYM4 423 aa27.32■■□□□ 1.96
ECHS1-201ENST00000368547 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
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ECHS1-201ENST00000368547 ZZEF1O43149 2961 aa27.32■■□□□ 1.96
ECHS1-201ENST00000368547 TTC36A6NLP5 189 aa27.31■■□□□ 1.96
ECHS1-201ENST00000368547 OR2J2O76002 312 aa27.31■■□□□ 1.96
ECHS1-201ENST00000368547 NKX2-2O95096 273 aa27.31■■□□□ 1.96
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ECHS1-201ENST00000368547 PIK3R3Q92569 461 aa27.31■■□□□ 1.96
ECHS1-201ENST00000368547 CDS1Q92903 461 aa27.31■■□□□ 1.96
ECHS1-201ENST00000368547 RAB8BQ92930 207 aa27.31■■□□□ 1.96
ECHS1-201ENST00000368547 STACQ99469 402 aa27.31■■□□□ 1.96
ECHS1-201ENST00000368547 PIGUQ9H490 435 aa27.31■■□□□ 1.96
ECHS1-201ENST00000368547 KCNE3Q9Y6H6 103 aa27.31■■□□□ 1.96
ECHS1-201ENST00000368547 MGAQ8IWI9 3026 aa27.31■■□□□ 1.96
ECHS1-201ENST00000368547 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa27.31■■□□□ 1.96
ECHS1-201ENST00000368547 GSTA4O15217 222 aa27.3■■□□□ 1.96
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