RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 SSR3Q9UNL2 185 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A0G2JPF8 293 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 CASC3O15234 703 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 S100A1P23297 94 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 ETV5P41161 510 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 ACTR1BP42025 376 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 ETV1P50549 477 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 ACTR1AP61163 376 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 GNA13Q14344 377 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF750Q32MQ0 723 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF544Q6NX49 715 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 NRARPQ7Z6K4 114 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 KIF18BQ86Y91 864 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 OR8K5Q8NH50 307 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 PINK1Q9BXM7 581 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 SNTG1Q9NSN8 517 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 RGS13O14921 159 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 ERI3O43414 337 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 GABRG2P18507 467 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR50Q13585 617 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 FLYWCH1Q4VC44 716 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 ABHD17CQ6PCB6 329 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 BHLHB9Q6PI77 547 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC116Q8IYX3 515 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 ACOT4Q8N9L9 421 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR151Q8TDV0 419 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 TPSD1Q9BZJ3 242 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 CYP8B1Q9UNU6 501 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCA7Q8IZY2 2146 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 RGS5O15539 181 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 CPEP16870 476 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 RAB8AP61006 207 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 USP30Q70CQ3 517 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 CAPSLQ8WWF8 208 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 C16orf58Q96GQ5 468 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC6A20Q9NP91 592 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 CTPS2Q9NRF8 586 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNE3Q9Y6H6 103 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 GSTM3P21266 225 aa17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 TEAD1P28347 426 aa17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 SMSP52788 366 aa17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 RPE65Q16518 533 aa17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 CES1P1Q9UKY3 287 aa17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF232Q9UNY5 417 aa17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 ISM1B1AKI9 464 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 RFX2P48378 723 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 COPZ1P61923 177 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 PSPHP78330 225 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 BNC1Q01954 994 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF79Q15937 498 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 KLHL22Q53GT1 634 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 MRGPREQ86SM8 312 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 DOK4Q8TEW6 326 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 NEDD4LQ96PU5 975 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 TIMM29Q9BSF4 260 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRA2Q9H9E1 313 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A087WUU8 490 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 TTC36A6NLP5 189 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 BTN3A3O00478 584 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 KRT8P05787 483 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 FHP07954 510 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 C1orf61Q13536 156 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 SNAPC1Q16533 368 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 GPAT3Q53EU6 434 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 C3orf38Q5JPI3 329 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 NXNL2Q5VZ03 156 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 LAX1Q8IWV1 398 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 OR56A1Q8NGH5 318 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 OR10G6Q8NH81 332 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 MOAP1Q96BY2 351 aa17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms