RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 BIN3Q9NQY0 253 aa15.25■□□□□ 0.03
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RXRA-201ENST00000356384 ARPC5O15511 151 aa15.25■□□□□ 0.03
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RXRA-201ENST00000356384 C16orf78Q8WTQ4 265 aa15.23■□□□□ 0.03
RXRA-201ENST00000356384 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa15.23■□□□□ 0.03
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