RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 DLGAP1O14490 977 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 SCRG1O75711 98 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 DIRAS3O95661 229 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CCR7P32248 378 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 DCAF7P61962 342 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 NPRL3Q12980 569 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 TMPRSS12Q86WS5 348 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 PRR22Q8IZ63 422 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 MS4A15Q8N5U1 240 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 MOCOSQ96EN8 888 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 AIFM2Q9BRQ8 373 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 NUDT15Q9NV35 164 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 MARCH5Q9NX47 278 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 M0R129 80 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 VNN2O95498 520 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 C7P10643 843 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ACPPP15309 386 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 RGNQ15493 299 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF709Q8N972 641 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF480Q8WV37 535 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF700Q9H0M5 742 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CENPBD1B2RD01 187 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 RBBP9O75884 186 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 APLNRP35414 380 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 AHRP35869 848 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 FAM189BP81408 668 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF675Q8TD23 568 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 TCEAL3Q969E4 200 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 GAREM1Q9H706 876 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 LHX3Q9UBR4 397 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ICKQ9UPZ9 632 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 FCER2P06734 321 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CTHP32929 405 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 HTR3AP46098 478 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 DAP3P51398 398 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM240Q5SV17 173 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 WDR20Q8TBZ3 569 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 PTERQ96BW5 349 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 MUS81Q96NY9 551 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 GPR160Q9UJ42 338 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CA5BQ9Y2D0 317 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 APOL3O95236 402 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 C1orf105O95561 183 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 RACK1P63244 317 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 OR13C3Q8NGS6 347 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 DNTTIP1Q9H147 329 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF175Q9Y473 711 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ACTL6BO94805 426 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 LCATP04180 440 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 IVDP26440 423 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 AOAHP28039 575 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ARL6IP1Q15041 203 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 NADK2Q4G0N4 442 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 NADSYN1Q6IA69 706 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 FCAMRQ8WWV6 532 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 NTMT1Q9BV86 223 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 MYH11P35749 1972 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 SLC19A2O60779 497 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ADH7P40394 386 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 RGRP47804 291 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 SAMD12Q8N8I0 201 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 WACQ9BTA9 647 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ATG5Q9H1Y0 275 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 MYNNQ9NPC7 610 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 EMC3Q9P0I2 261 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 SIGLEC6O43699 453 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 GPR75O95800 540 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 BMP4P12644 408 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 PRKXP51817 358 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 MAZP56270 477 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 BCL2L15Q5TBC7 163 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CASTOR1Q8WTX7 329 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 GATAD2BQ8WXI9 593 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ADOQ96SZ5 270 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 RIMS3Q9UJD0 308 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CASC3O15234 703 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 LDB3O75112 727 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 PEX14O75381 377 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms