RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 NOTCH3Q9UM47 2321 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 HDAC3O15379 428 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SOX30O94993 753 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TIAF1O95411 115 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PROCP04070 461 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ITGAMP11215 1152 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 ATG9BQ674R7 924 aa4.13□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa4.13□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 VPS33AQ96AX1 596 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 GNRHR2Q96P88 292 aa4.13□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC35A5Q9BS91 424 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 POPDC3Q9HBV1 291 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 DMRT3Q9NQL9 472 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SCN3AQ9NY46 2000 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PLSCR5A0PG75 271 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SLC22A20A6NK97 555 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NPIPA7E9PJI5 369 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 BIRC5O15392 142 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TMCC2O75069 709 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 AIFM1O95831 613 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NPIPA8P0DM63 369 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CD247P20963 164 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CD96P40200 585 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PIK3CBP42338 1070 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MAGEA8P43361 318 aa4.13□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC18A1P54219 525 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NR1D2Q14995 579 aa4.13□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF311Q5JNZ3 666 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 GRHL2Q6ISB3 625 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 KIRREL2Q6UWL6 708 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OR52L1Q8NGH7 329 aa4.13□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 UCK1Q9HA47 277 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 EFCAB1Q9HAE3 211 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ZFP64Q9NPA5 681 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 DAPP1Q9UN19 280 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 HELZP42694 1942 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 MRASO14807 208 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 LCKP06239 509 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SP1P08047 785 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ADORA3P0DMS8 318 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 COL8A1P27658 744 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 SLC26A3P40879 764 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 RPS26P62854 115 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TLE4Q04727 773 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CHRNB3Q05901 458 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 GCNT6Q5T4J0 391 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 HBMQ6B0K9 141 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ZYG11AQ6WRX3 759 aa4.12□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 CDRT4Q8N9R6 151 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 OR56A3Q8NH54 315 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf216Q8TAB5 229 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ENKD1Q9H0I2 346 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 CENPMQ9NSP4 180 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 TINAGQ9UJW2 476 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 ATG4BQ9Y4P1 393 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 C5orf42Q9H799 3197 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa4.12□□□□□ -1.75
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