RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 UCK2Q9BZX2 261 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 FSCN3Q9NQT6 498 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 CTPS2Q9NRF8 586 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 RASSF1Q9NS23 344 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 CUTCQ9NTM9 273 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 KLHL28Q9NXS3 571 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 SEMA5BQ9P283 1151 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 ENOPH1Q9UHY7 261 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 IFT52Q9Y366 437 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 CLDN16Q9Y5I7 305 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 A0A1B0GTQ1 180 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 GXYLT2A0PJZ3 443 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 H3BMH7 237 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 STX11O75558 287 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 AK1P00568 194 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 S1PR1P21453 382 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 GSTT1P30711 240 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 GABRA3P34903 492 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 CXCR4P61073 352 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 GPR68Q15743 365 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 PLK5Q496M5 336 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 PGBD2Q6P3X8 592 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 SPARTQ8N0X7 666 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 CLIP4Q8N3C7 705 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 D2HGDHQ8N465 521 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 FAM81AQ8TBF8 368 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 SLC7A13Q8TCU3 470 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 NR4A3Q92570 626 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 PIGKQ92643 395 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 RIT1Q92963 219 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 DGAT2Q96PD7 388 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 PRR14Q9BWN1 585 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 FANCEQ9HB96 536 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 VCX3AQ9NNX9 186 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 FTSJ1Q9UET6 329 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 MAU2Q9Y6X3 613 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 PCDH15Q96QU1 1955 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 AGAP5A6NIR3 686 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 A8MU76 341 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 PTGES3LE9PB15 166 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF749O43361 778 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 TPST2O60704 377 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 FAM20BO75063 409 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 WBP4O75554 376 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 NKX2-2O95096 273 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 MAOAP21397 527 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 KRT20P35900 424 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 STT3AP46977 705 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 CRISP1P54107 249 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 TAS2R41P59536 307 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 RAB39AQ14964 217 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 FIGNL1Q6PIW4 674 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 NLGN4XQ8N0W4 816 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 OR1L3Q8NH93 324 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 SLC41A2Q96JW4 573 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 DGCR6LQ9BY27 220 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 SAP130Q9H0E3 1048 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 FOLH1BQ9HBA9 442 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 ENAMQ9NRM1 1142 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 FBXO34Q9NWN3 711 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 SCN3BQ9NY72 215 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF232Q9UNY5 417 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 TPRKBQ9Y3C4 175 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 SNX5Q9Y5X3 404 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF548-201ENST00000336128 OR2W5A6NFC9 320 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-201ENST00000336128 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-201ENST00000336128 HRKO00198 91 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-201ENST00000336128 KIAA0513O60268 411 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-201ENST00000336128 THBS1P07996 1170 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-201ENST00000336128 CCNYL3P0C7X3 344 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-201ENST00000336128 ATXN8OSP0DMR3 200 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-201ENST00000336128 SSTR4P31391 388 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-201ENST00000336128 IDH2P48735 452 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-201ENST00000336128 HSD17B7P56937 341 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-201ENST00000336128 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-201ENST00000336128 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-201ENST00000336128 NR0B2Q15466 257 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-201ENST00000336128 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-201ENST00000336128 PROX2Q3B8N5 592 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-201ENST00000336128 EIPR1Q53HC9 387 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-201ENST00000336128 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-201ENST00000336128 TTLL10Q6ZVT0 673 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-201ENST00000336128 KMT5CQ86Y97 462 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-201ENST00000336128 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-201ENST00000336128 DEPDC4Q8N2C3 294 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-201ENST00000336128 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-201ENST00000336128 NODALQ96S42 347 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-201ENST00000336128 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-201ENST00000336128 CAPN10Q9HC96 672 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF226Q9NYT6 803 aa11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms