RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 NIPAL1Q6NVV3 410 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 PGBD2Q6P3X8 592 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 VWA5B2Q8N398 1253 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 COX18Q8N8Q8 333 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 OR51Q1Q8NH59 317 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 UCK2Q9BZX2 261 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 REV1Q9UBZ9 1251 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
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ACTB-201ENST00000331789 NTNG1Q9Y2I2 539 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 CLDN16Q9Y5I7 305 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 H3BMH7 237 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 ADAP00813 363 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
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ACTB-201ENST00000331789 MAOAP21397 527 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 PEX19P40855 299 aa16.66■□□□□ 0.26
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ACTB-201ENST00000331789 CXCR4P61073 352 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 HSD11B2P80365 405 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP16.66■□□□□ 0.269e-19■■■■■ 27
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ACTB-201ENST00000331789 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 FIGNL1Q6PIW4 674 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
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ACTB-201ENST00000331789 PLXDC1Q8IUK5 500 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 GALNT12Q8IXK2 581 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 PEX5LQ8IYB4 626 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 RIT1Q92963 219 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 NODALQ96S42 347 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 STACQ99469 402 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 CCDC90BQ9GZT6 254 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 ZNF350Q9GZX5 532 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 DUSP22Q9NRW4 184 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 ZNF226Q9NYT6 803 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 FTSJ1Q9UET6 329 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 SLC6A14Q9UN76 642 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 IFT52Q9Y366 437 aa16.66■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 NPIPA7E9PJI5 369 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 M0R129 80 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 CLDN4O14493 209 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
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ACTB-201ENST00000331789 NPIPA8P0DM63 369 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 CHMP24386 653 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 POU1F1P28069 291 aa16.65■□□□□ 0.26
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ACTB-201ENST00000331789 GPR3P46089 330 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 MAPK10P53779 464 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 MAPK14Q16539 360 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 PROX2Q3B8N5 592 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 CCDC74AQ96AQ1 378 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 DUSP21Q9H596 190 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 CUTCQ9NTM9 273 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 SCN3BQ9NY72 215 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 PILRBQ9UKJ0 227 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 ZNF232Q9UNY5 417 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 TPRKBQ9Y3C4 175 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 AGAP5A6NIR3 686 aa16.64■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 STX11O75558 287 aa16.64■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 NTN1O95631 604 aa16.64■□□□□ 0.26
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ACTB-201ENST00000331789 SLC5A2P31639 672 aa16.64■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 TAS2R41P59536 307 aa16.64■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP16.64■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 NR1D2Q14995 579 aa16.64■□□□□ 0.26
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ACTB-201ENST00000331789 TTLL10Q6ZVT0 673 aa16.64■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 ZNF619Q8N2I2 560 aa16.64■□□□□ 0.26
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ACTB-201ENST00000331789 RHOXF1Q8NHV9 184 aa16.64■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa16.64■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 SEMA4GQ9NTN9 838 aa16.64■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 KLHL28Q9NXS3 571 aa16.64■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 KCNE5Q9UJ90 142 aa16.64■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 CDC14AQ9UNH5 594 aa16.64■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 SATB2Q9UPW6 733 aa16.64■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 SNX5Q9Y5X3 404 aa16.64■□□□□ 0.26
ACTB-201ENST00000331789 BLACEA4D250 179 aa16.64■□□□□ 0.25
ACTB-201ENST00000331789 CCNYL3P0C7X3 344 aa16.64■□□□□ 0.25
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