RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 RARRES3Q9UL19 164 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 IFT52Q9Y366 437 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ENPP4Q9Y6X5 453 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 U3KQV3 271 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 A8MVJ9 347 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAJB5O75953 348 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 DIRAS1O95057 198 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ALPPP05187 535 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 GP1BAP07359 652 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 THRBP10828 461 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CD247P20963 164 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PRKACGP22612 351 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 IFNA8P32881 189 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CAPGP40121 348 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ADH7P40394 386 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 IST1P53990 364 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 RAC1P63000 192 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 BTG2P78543 158 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MAPK11Q15759 364 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 IQCCQ4KMZ1 466 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF311Q5JNZ3 666 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MFSD4BQ5TF39 518 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 RHBDD2Q6NTF9 364 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 DBX2Q6ZNG2 339 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 C20orf204Q6ZNR8 217 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PEX5LQ8IYB4 626 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 COX18Q8N8Q8 333 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF555Q8NEP9 628 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR151Q8TDV0 419 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PINK1Q9BXM7 581 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 RBCK1Q9BYM8 510 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ARMC7Q9H6L4 198 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRA2Q9H9E1 313 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 POLE3Q9NRF9 147 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 TMCC3Q9ULS5 477 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SATB2Q9UPW6 733 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNE3Q9Y6H6 103 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SYT5O00445 386 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 FLRT2O43155 660 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 HS6ST1O60243 411 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PRAMEF2O60811 474 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 STX11O75558 287 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 LGI1O95970 557 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CHRM4P08173 479 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ANXA8P13928 327 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 IL7RP16871 459 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 S1PR1P21453 382 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 RRM2P31350 389 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 GABRA3P34903 492 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 HMGA2P52926 109 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP2R2BQ00005 443 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 OCA2Q04671 838 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CHRNEQ04844 493 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 IL11RAQ14626 422 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 DUSP5Q16690 384 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC36A3Q495N2 470 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MINDY4Q4G0A6 757 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PHF19Q5T6S3 580 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGAP40Q5TG30 622 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MLIPQ5VWP3 458 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 LAIR1Q6GTX8 287 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 QSOX2Q6ZRP7 698 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CARM1Q86X55 608 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ATG16L2Q8NAA4 619 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 OR7G1Q8NGA0 311 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 OR52R1Q8NGF1 315 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 GIPC3Q8TF64 312 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 NR4A3Q92570 626 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CDS1Q92903 461 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC74BQ96LY2 380 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 OR6C1Q96RD1 312 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD60Q9BZ19 345 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC38A1Q9H2H9 487 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SMURF2Q9HAU4 748 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 PRODH2Q9UF12 536 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CFL2Q9Y281 166 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR45Q9Y484 360 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 CEP192Q8TEP8 1941 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 SCN3AQ9NY46 2000 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-201ENST00000319942 UGT2B11O75310 529 aa9.4□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms