RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 MFSD9Q8NBP5 474 aa14.83□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 AGBL5Q8NDL9 886 aa14.83□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 OR2L5Q8NG80 312 aa14.83□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 GPR32P1Q8NGA4 272 aa14.83□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 OR9Q2Q8NGE9 314 aa14.83□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 RHOXF1Q8NHV9 184 aa14.83□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 TBC1D15Q8TC07 691 aa14.83□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 TANKQ92844 425 aa14.83□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 CD180Q99467 661 aa14.83□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 PSD2Q9BQI7 771 aa14.83□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SERHL2Q9H4I8 314 aa14.83□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SOHLH2Q9NX45 425 aa14.83□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 RHCGQ9UBD6 479 aa14.83□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 PISDQ9UG56 409 aa14.83□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ENPP5Q9UJA9 477 aa14.83□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 PLD2O14939 933 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 PGRMC2O15173 223 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC28A2O43868 658 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 MAN1A2O60476 641 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 JMJD7P0C870 316 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 OR12D1P0DN82 309 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ETV5P41161 510 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 MASP1P48740 699 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ARFIP1P53367 373 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF425Q6IV72 752 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 PRSS42Q7Z5A4 293 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 PROX1Q92786 737 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC22A18Q96BI1 424 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 RNF31Q96EP0 1072 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC35G5Q96KT7 338 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ALPK1Q96QP1 1244 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF607Q96SK3 696 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ASPMQ8IZT6 3477 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 FFAR1O14842 300 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 CBLP22681 906 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 NTSP30990 170 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 GSSP48637 474 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 LIM2P55344 173 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SYPL1Q16563 259 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 P3H2Q8IVL5 708 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 XAGE5Q8WWM1 108 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 OR51I1Q9H343 314 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ACOT13Q9NPJ3 140 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 KCND3Q9UK17 655 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ATG4BQ9Y4P1 393 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 NCOR2Q9Y618 2525 aa14.82□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 NINQ8N4C6 2090 aa14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A0J9YY10 115 aa14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ANKRD34CP0C6C1 535 aa14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 POU2F1P14859 743 aa14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 MAGP20916 626 aa14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 NR4A1P22736 598 aa14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 KCNJ5P48544 419 aa14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 MVKQ03426 396 aa14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 CTF1Q16619 201 aa14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 COLEC12Q5KU26 742 aa14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 MLIPQ5VWP3 458 aa14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC81Q6ZN84 652 aa14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SZRD1Q7Z422 152 aa14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 KLHL6Q8WZ60 621 aa14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 CTRCQ99895 268 aa14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 TWSG1Q9GZX9 223 aa14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SYNPO2LQ9H987 977 aa14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF226Q9NYT6 803 aa14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 P2RX2Q9UBL9 471 aa14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 TRPC4Q9UBN4 977 aa14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 FBXW2Q9UKT8 454 aa14.81□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ARRDC5A6NEK1 342 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 TNFSF15O95150 251 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 GASTP01350 101 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 NR2F1P10589 423 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 FOLR1P15328 257 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 RAB8AP61006 207 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 HSD11B2P80365 405 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SHC2P98077 582 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 RELAQ04206 551 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 AQP6Q13520 282 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms