RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 A0A096LPI6 279 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 TP53I11O14683 189 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 KCNH1O95259 989 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 ZCCHC18P0CG32 403 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 MAPRE2Q15555 327 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 DECR1Q16698 335 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 BCORP1Q8N888 145 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 Q8NA96 180 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 SLC35A4Q96G79 324 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 SCMH1Q96GD3 660 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 OR7D2Q96RA2 312 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 ADOQ96SZ5 270 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 STACQ99469 402 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 PIGUQ9H490 435 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 SERHL2Q9H4I8 314 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 DUSP22Q9NRW4 184 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 SLAMF8Q9P0V8 285 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 ANAPC2Q9UJX6 822 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 LOC100653049A0A140TA62 436 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 SLC22A2O15244 555 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 NME2P1O60361 137 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 UGT2B11O75310 529 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 KRT34O76011 436 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 CCL3P10147 92 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 NME2P22392 152 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 PTPN6P29350 595 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 PIGAP37287 484 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 MAN2A2P49641 1150 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 SLC22A10Q63ZE4 541 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 DESI1Q6ICB0 168 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 SNX32Q86XE0 403 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 RNF130Q86XS8 419 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 ZFP90Q8TF47 636 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 COL21A1Q96P44 957 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 PHF12Q96QT6 1004 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 OR51I1Q9H343 314 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 CFAP46Q8IYW2 2715 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 G3V3Y1 287 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 TSPAN2O60636 221 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 KRT75O95678 551 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 P04436 131 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 GPR85P60893 370 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 MMEL1Q495T6 779 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 NUP54Q7Z3B4 507 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 GALNT10Q86SR1 603 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 RETREG3Q86VR2 466 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 PAQR8Q8TEZ7 354 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 DIO2Q92813 273 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC106Q9BWC9 280 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 TPT1P8Q9HAU6 139 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 SACM1LQ9NTJ5 587 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 GIN1Q9NXP7 522 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 MAP10Q9P2G4 905 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 KCNE3Q9Y6H6 103 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 OR6C70A6NIJ9 312 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 DUXAA6NLW8 204 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 ABCB7O75027 752 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 KHKP50053 298 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 PNLIPRP2P54317 469 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 LRIF1Q5T3J3 769 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 CCNJQ5T5M9 372 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 PRAMEF20Q5VT98 475 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 FIGNL1Q6PIW4 674 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 BTBD2Q9BX70 525 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 IL1RL2Q9HB29 575 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 TTLL8A6PVC2 850 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 SOX30O94993 753 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 KCNK2O95069 426 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 IL33O95760 270 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 OR12D1P0DN82 309 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 RPP38P78345 283 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 NFYCQ13952 458 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 EFR3AQ14156 821 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 DHDDSQ86SQ9 333 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 SULF2Q8IWU5 870 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 POU5F2Q8N7G0 328 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 SPPL2AQ8TCT8 520 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 MIPOL1Q8TD10 442 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 RAB8BQ92930 207 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 HGDQ93099 445 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 TMCO6Q96DC7 493 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 MYLK2Q9H1R3 596 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD4-201ENST00000306324 SH2D2AQ9NP31 389 aa20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms