RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299162.9

FOXN4-201, Transcript of forkhead box N4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN4, Length 3,350 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4-201ENST00000299162 DCST1Q5T197 706 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 FAHD1Q6P587 224 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 CAMKMTQ7Z624 323 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 TCEANCQ8N8B7 351 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 OR2L3Q8NG85 312 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 OR5P2Q8WZ92 322 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 YIPF6Q96EC8 236 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 TEX101Q9BY14 249 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 BTBD1Q9H0C5 482 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 SLC13A4Q9UKG4 626 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 CLCA2Q9UQC9 943 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 PRSS38A1L453 326 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 SERTM1A2A2V5 107 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 MEIOCA2RUB1 952 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 NPIPA7E9PJI5 369 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 KIAA0513O60268 411 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 ADH1BP00325 375 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 NPIPA8P0DM63 369 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 REEP5Q00765 189 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF33BQ06732 778 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 RPA4Q13156 261 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 IL18R1Q13478 541 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 KEAP1Q14145 624 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 PROX2Q3B8N5 592 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 IQCHQ86VS3 1027 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 SLC34A3Q8N130 599 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 FAM109AQ8N4B1 249 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 B3GNT7Q8NFL0 401 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 SLC38A4Q969I6 547 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 AMDHD1Q96NU7 426 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 OR5M11Q96RB7 305 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 MENTQ9BUN1 341 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 CDADC1Q9BWV3 514 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 GHITMQ9H3K2 345 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 MSRAQ9UJ68 235 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 CCDC182A6NF36 153 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 OR2W5A6NFC9 320 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 METTL15A6NJ78 407 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 LDB3O75112 727 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 UGT2B17O75795 530 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 PAHP00439 452 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 PPP2R1BP30154 601 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 GABARAPL2P60520 117 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 TSTQ16762 297 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 BTBD16Q32M84 506 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 TCTN3Q6NUS6 607 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 FAM131AQ6UXB0 335 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 VRK2Q86Y07 508 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 OR8H1Q8NGG4 311 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 OR6T1Q8NGN1 323 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 PHF21AQ96BD5 680 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 MTERF3Q96E29 417 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 WDR34Q96EX3 536 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 HRASLS5Q96KN8 279 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 QRFPRQ96P65 431 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 FNDC11Q9BVV2 318 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 DUSP21Q9H596 190 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 ADAP2Q9NPF8 381 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 TMEM74BQ9NUR3 256 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF226Q9NYT6 803 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 PIAS3Q9Y6X2 628 aa9.5□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 OR6C74A6NCV1 312 aa9.49□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 WWP2O00308 870 aa9.49□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 ANXA8P13928 327 aa9.49□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 GGT2P36268 569 aa9.49□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 XCR1P46094 333 aa9.49□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 CDC42P60953 191 aa9.49□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 RTL10Q7L3V2 364 aa9.49□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 PRSS41Q7RTY9 318 aa9.49□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 SLC7A13Q8TCU3 470 aa9.49□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 GPR151Q8TDV0 419 aa9.49□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 TRIM63Q969Q1 353 aa9.49□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 MCCC2Q9HCC0 563 aa9.49□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 CNIH4Q9P003 139 aa9.49□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 MAPRE3Q9UPY8 281 aa9.49□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 POFUT2Q9Y2G5 429 aa9.49□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 MUC3AQ02505 3323 aa9.49□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa9.49□□□□□ -0.89
FOXN4-201ENST00000299162 ISPDA4D126 451 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 197.6 ms