RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229265.10

CDCA3-201, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDCA3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-201ENST00000229265 OR7D2Q96RA2 312 aa9.97□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 SLC38A3Q99624 504 aa9.97□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 VNN3Q9NY84 501 aa9.97□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 TRPC4Q9UBN4 977 aa9.97□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 ACSL6Q9UKU0 697 aa9.97□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 CACNA1GO43497 2377 aa9.97□□□□□ -0.81
CDCA3-201ENST00000229265 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 A0A1W2PQM1 296 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 PRAMEF25A6NGN4 478 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 KALRNO60229 2985 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 BRINP1O60477 761 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 COQ9O75208 318 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ANGPTL1O95841 491 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 H1F0P07305 194 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ITIH1P19827 911 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 CBLP22681 906 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 AQP1P29972 269 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 FEN1P39748 380 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 MAP3K8P41279 467 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 CAPZBP47756 277 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 GPLD1P80108 840 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 IL5RAQ01344 420 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 SPIBQ01892 262 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 LSAMPQ13449 338 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 NR1D2Q14995 579 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 SYPL1Q16563 259 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 DEFB134Q4QY38 66 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 C14orf28Q4W4Y0 310 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 SLC25A30Q5SVS4 291 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 MFSD12Q6NUT3 480 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 KCTD8Q6ZWB6 473 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 PEX5LQ8IYB4 626 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 OFCC1Q8IZS5 231 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 HS3ST5Q8IZT8 346 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 SPARTQ8N0X7 666 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 OR4N4Q8N0Y3 316 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 CA13Q8N1Q1 262 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 GPR32P1Q8NGA4 272 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 IFI44Q8TCB0 444 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 KLHL6Q8WZ60 621 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 MYDGFQ969H8 173 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 PMEPA1Q969W9 287 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 GIMAP5Q96F15 307 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 Q96MT0 163 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 NODALQ96S42 347 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 CCDC3Q9BQI4 270 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 FUZQ9BT04 418 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ADNPQ9H2P0 1102 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 CXorf21Q9HAI6 301 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 PDE7BQ9NP56 450 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 NDOR1Q9UHB4 597 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 TESMINQ9Y4I5 508 aa9.96□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 A0A0G2JN53 185 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 CPED1A4D0V7 1026 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 HTR3EA5X5Y0 456 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 TLCD2A6NGC4 264 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 H3BSA7 217 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 SLC1A7O00341 560 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 FMO6PO60774 539 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 TRMUO75648 421 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 SEC14L2O76054 403 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 CLIC3O95833 236 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 MT-CO3P00414 261 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 PRB1P04280 392 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ALPPP05187 535 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ALOX5P09917 674 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 RNH1P13489 461 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 OSMP13725 252 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 GLB1P16278 677 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 DCKP27707 260 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 PIGAP37287 484 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 OR1E2P47887 323 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 AVPR1BP47901 424 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 LSSP48449 732 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 CRISP1P54107 249 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 PRKAG1P54619 331 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 CDH12P55289 794 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 HSD17B7P56937 341 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 CDC42P60953 191 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 SLC35A2P78381 396 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 ST3GAL3Q11203 375 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 RAPSNQ13702 412 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 SERTAD2Q14140 314 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 GPR19Q15760 415 aa9.95□□□□□ -0.82
CDCA3-201ENST00000229265 MEP1AQ16819 746 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms