RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637003.1

ARID1B-222, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5 BASIC

Gene ARID1B, Length 1,290 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-222	ENST00000637003	FOXO1	Q12778	655 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	OGFOD2	Q6N063	350 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	ANKRD46	Q86W74	232 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	PIK3R3	Q92569	461 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	GIMAP5	Q96F15	307 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	MAGEB18	Q96M61	343 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	DOHH	Q9BU89	302 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	FLNC	Q14315	2725 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	SVIL	O95425	2214 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	SLITRK5	O94991	958 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	CELA3A	P09093	270 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	GABRA3	P34903	492 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	SOAT1	P35610	550 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	CASP3	P42574	277 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	DGKQ	P52824	942 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	C21orf58	P58505	322 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	EPGN	Q6UW88	154 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	GK5	Q6ZS86	529 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	GALNT10	Q86SR1	603 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC9A6	Q92581	669 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	COL21A1	Q96P44	957 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	EBF4	Q9BQW3	602 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	CNIH4	Q9P003	139 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	C17orf51	A8MQB3	221 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	GNB5	O14775	395 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	TSPAN2	O60636	221 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	ACP2	P11117	423 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	NAGA	P17050	411 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	IL12B	P29460	328 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	KRT20	P35900	424 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	MAGEA5	P43359	124 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	KIR3DL1	P43629	444 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	IDH3A	P50213	366 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	AQP5	P55064	265 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	HBA1	P69905	142 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	TP53BP2	Q13625	1128 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	MLC1	Q15049	377 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	GPR151	Q8TDV0	419 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	JADE3	Q92613	823 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	RILP	Q96NA2	401 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	CBLC	Q9ULV8	474 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARID1B-222	ENST00000637003	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARID1B-222	ENST00000637003		A0A1B0GTH9	108 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARID1B-222	ENST00000637003		E9PBE3	544 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARID1B-222	ENST00000637003	ACOT7	O00154	380 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARID1B-222	ENST00000637003	UBD	O15205	165 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARID1B-222	ENST00000637003	SCN2B	O60939	215 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARID1B-222	ENST00000637003	IGKV1D-16	P01601	117 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARID1B-222	ENST00000637003	RNF224	P0DH78	156 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARID1B-222	ENST00000637003	CYP4B1	P13584	511 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARID1B-222	ENST00000637003	S100A3	P33764	101 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARID1B-222	ENST00000637003	PTGDS	P41222	190 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARID1B-222	ENST00000637003	MASP1	P48740	699 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARID1B-222	ENST00000637003	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ARID1B-222	ENST00000637003	CASP9	P55211	416 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARID1B-222	ENST00000637003	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ARID1B-222	ENST00000637003	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
ARID1B-222	ENST00000637003	DUSP5	Q16690	384 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARID1B-222	ENST00000637003	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARID1B-222	ENST00000637003	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARID1B-222	ENST00000637003	PAOX	Q6QHF9	649 aa		13.89	□□□□□ -0.19

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