RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 SLC6A7Q99884 636 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF416Q9BWM5 594 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PDZD7Q9H5P4 517 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ADGRB1O14514 1584 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 H3BSA7 217 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 SOX15O60248 233 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 AMY2AP04746 511 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 CELP19835 753 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 NMBRP28336 390 aa6.07□□□□□ -1.44
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SCN2A-209ENST00000636071 TMEM225Q6GV28 225 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ASPGQ86U10 573 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 OR6C4Q8NGE1 309 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 OR6N2Q8NGY6 317 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 STT3BQ8TCJ2 826 aa6.07□□□□□ -1.44
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SCN2A-209ENST00000636071 UCN3Q969E3 161 aa6.07□□□□□ -1.44
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SCN2A-209ENST00000636071 RNF208Q9H0X6 261 aa6.07□□□□□ -1.44
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SCN2A-209ENST00000636071 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 GMEB2Q9UKD1 530 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 KPTNQ9Y664 436 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 LMO7Q8WWI1 1683 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 KIAA0513O60268 411 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 CSTAP01040 98 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 TBPP20226 339 aa6.07□□□□□ -1.44
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SCN2A-209ENST00000636071 ABCG1P45844 678 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 LAPTM4AQ15012 233 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PKDCCQ504Y2 493 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PAGE3Q5JUK9 113 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 LCTLQ6UWM7 567 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 C16orf78Q8WTQ4 265 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 C7orf34Q96L11 122 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 COG8Q96MW5 612 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF681Q96N22 645 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 SORCS2Q96PQ0 1159 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 EBPLQ9BY08 206 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 EMC7Q9NPA0 242 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ACP6Q9NPH0 428 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF226Q9NYT6 803 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.07□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ANKRD66B4E2M5 251 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PPP1R2P9O14990 202 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 SEPT4O43236 478 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 F2RL1P55085 397 aa6.06□□□□□ -1.44
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SCN2A-209ENST00000636071 P2RY14Q15391 338 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 AVPI1Q5T686 147 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 SERPINA11Q86U17 422 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 OR4N5Q8IXE1 308 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 SUMF1Q8NBK3 374 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 OR51L1Q8NGJ5 315 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 IRF7Q92985 503 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
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SCN2A-209ENST00000636071 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 MAN2B1O00754 1011 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 MPPED1O15442 326 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 POU2F1P14859 743 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 BCKDHBP21953 392 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 RFX2P48378 723 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ANKRD46Q86W74 232 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 SULF2Q8IWU5 870 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF100Q8IYN0 542 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 COMMD1Q8N668 190 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 OR8S1Q8NH09 359 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 OR8K3Q8NH51 312 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PINK1Q9BXM7 581 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 CDH20Q9HBT6 801 aa6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 DMAC2Q9NW81 257 aa6.06□□□□□ -1.44
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