RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 RAB39AQ14964 217 aa20.14■□□□□ 0.81
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SGMS1-210ENST00000619438 LAIR2Q6ISS4 152 aa20.14■□□□□ 0.81
SGMS1-210ENST00000619438 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SGMS1-210ENST00000619438 MMP21Q8N119 569 aa20.14■□□□□ 0.81
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SGMS1-210ENST00000619438 PSMA8Q8TAA3 256 aa20.14■□□□□ 0.81
SGMS1-210ENST00000619438 TAMM41Q96BW9 452 aa20.14■□□□□ 0.81
SGMS1-210ENST00000619438 CXorf36Q9H7Y0 433 aa20.14■□□□□ 0.81
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SGMS1-210ENST00000619438 PITX2Q99697 317 aa20.12■□□□□ 0.81
SGMS1-210ENST00000619438 C17orf62Q9BQA9 187 aa20.12■□□□□ 0.81
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SGMS1-210ENST00000619438 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa20.12■□□□□ 0.81
SGMS1-210ENST00000619438 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SGMS1-210ENST00000619438 CFAP46Q8IYW2 2715 aa20.11■□□□□ 0.81
SGMS1-210ENST00000619438 SLC1A7O00341 560 aa20.11■□□□□ 0.81
SGMS1-210ENST00000619438 DNAJB5O75953 348 aa20.11■□□□□ 0.81
SGMS1-210ENST00000619438 SEC14L2O76054 403 aa20.11■□□□□ 0.81
SGMS1-210ENST00000619438 CLK3P49761 638 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SGMS1-210ENST00000619438 MANFP55145 182 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
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