RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617087.1

PVT1-225, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 130 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-225	ENST00000617087	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087		A8MUI8	341 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087		K7EQM0	130 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	CLDN5	O00501	218 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	CTAGE5	O15320	804 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	EDIL3	O43854	480 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	PDE5A	O76074	875 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	RHOBTB1	O94844	696 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	OPN1MW	P04001	364 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	PDHB	P11177	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	ZNF85	Q03923	595 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	LY6D	Q14210	128 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	TATDN3	Q17R31	274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	RPAIN	Q86UA6	219 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	OR52J3	Q8NH60	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	ART4	Q93070	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	NTNG2	Q96CW9	530 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	ZNF607	Q96SK3	696 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	POLD4	Q9HCU8	107 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	SPATA2	Q9UM82	520 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	PPIAL4D	F5H284	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	IDH3B	O43837	385 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	ANP32D	O95626	131 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	FCGR3A	P08637	254 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	UGT1A4	P22310	534 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	CALML3	P27482	149 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	PTGER3	P43115	390 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	SLC7A2	P52569	658 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	IL24	Q13007	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	SELPLG	Q14242	412 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	CCL14	Q16627	93 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087		Q8NBF4	154 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	RLN3	Q8WXF3	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	UPRT	Q96BW1	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	KIF16B	Q96L93	1317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	SOCS3	O14543	225 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	TM9SF1	O15321	606 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	OR1F1	O43749	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	DUX1	O43812	170 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	NEBL	O76041	1014 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	MT-ND1	P03886	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	PSMA2	P25787	234 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	RGS4	P49798	205 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	HILS1	P60008	231 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	UBE2H	P62256	183 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	RAET1E	Q8TD07	263 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	SHC3	Q92529	594 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	SENP8	Q96LD8	212 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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