RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CYP7B1O75881 506 aa11.06□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa11.06□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NCF4Q15080 339 aa11.06□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FLYWCH1Q4VC44 716 aa11.06□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCNJQ5T5M9 372 aa11.06□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MTSS1LQ765P7 747 aa11.06□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR56A1Q8NGH5 318 aa11.06□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR52I1Q8NGK6 324 aa11.06□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HPS1Q92902 700 aa11.06□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GIMAP5Q96F15 307 aa11.06□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SNTG1Q9NSN8 517 aa11.06□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GIMAP4Q9NUV9 329 aa11.06□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SNX7Q9UNH6 387 aa11.06□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GUCY1B2O75343 617 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLITRK5O94991 958 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RASGRP1O95267 797 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NR2F6P10588 404 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CRYBB2P43320 205 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RHAGQ02094 409 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HYAL1Q12794 435 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CBX3Q13185 183 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATAT1Q5SQI0 421 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF730Q6ZMV8 503 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM92BQ6ZTR7 304 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 USP30Q70CQ3 517 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PAQR7Q86WK9 346 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NANOGP1Q8N7R0 232 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDS1Q92903 461 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ELSPBP1Q96BH3 223 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SIPA1Q96FS4 1042 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKHQ9HCJ1 492 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC13A4Q9UKG4 626 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM170BA6NMN3 283 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AGRPO00253 132 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLD2O14939 933 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SSX4O60224 188 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DLGAP3O95886 979 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ALPPP05187 535 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SOX6P35712 828 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDK5Q00535 292 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COX10Q12887 443 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MADCAM1Q13477 382 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPP2R2DQ66LE6 453 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC30A6Q6NXT4 461 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRSS41Q7RTY9 318 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR4N4Q8N0Y3 316 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM26EQ8N5C1 309 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADAMTS15Q8TE58 950 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BMFQ96LC9 184 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C10orf90Q96M02 699 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PINK1Q9BXM7 581 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SAP130Q9H0E3 1048 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C3orf14Q9HBI5 128 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR6C2Q9NZP2 312 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GSAPA4D1B5 854 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAF4O00268 1085 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MYL12BO14950 172 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 THY1P04216 161 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PVRP15151 417 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD79BP40259 229 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPR4P46093 362 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OCLNQ16625 522 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SDE2Q6IQ49 451 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NRROSQ86YC3 692 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PHC2Q8IXK0 858 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SFXN5Q8TD22 340 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SARGQ9BW04 601 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MND1Q9BWT6 205 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DZANK1Q9NVP4 752 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WDR70Q9NW82 654 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KLF15Q9UIH9 416 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CFL2Q9Y281 166 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa11.05□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCNK2O95069 426 aa11.04□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CPN2P22792 545 aa11.04□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RUNX2Q13950 521 aa11.04□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRRT3Q5FWE3 981 aa11.04□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPANXN2Q5MJ10 180 aa11.04□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ENTPD8Q5MY95 495 aa11.04□□□□□ -0.64
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.8 ms