RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598346.5

FARP1-223, Transcript of FERM, ARH/RhoGEF and pleckstrin domain protein 1, human

TSL 5

Gene FARP1, Length 756 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FARP1-223	ENST00000598346	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	LIME1	Q9H400	295 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	NT5DC2	Q9H857	520 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	JPT2	Q9H910	190 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	TJP1	Q07157	1748 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	TSPAN2	O60636	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	FCER2	P06734	321 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	LMO2	P25791	158 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	CCL11	P51671	97 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	CDKL1	Q00532	357 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	WASHC5	Q12768	1159 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	ITPK1	Q13572	414 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	PDK1	Q15118	436 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	LIPJ	Q5W064	366 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	LEMD2	Q8NC56	503 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	OR4F5	Q8NH21	305 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	P3H4	Q92791	437 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	CAPNS2	Q96L46	248 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	TNMD	Q9H2S6	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	SP140L	Q9H930	580 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	RARRES3	Q9UL19	164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	PALLD	Q8WX93	1383 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	MED23	Q9ULK4	1368 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	ALPP	P05187	535 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	PGK2	P07205	417 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	APRT	P07741	180 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	ALPPL2	P10696	532 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	SFN	P31947	248 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	SLC1A4	P43007	532 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	SST	P61278	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	DDI2	Q5TDH0	399 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	BNIPL	Q7Z465	357 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	SPATA2	Q9UM82	520 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	MYH3	P11055	1940 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	ZNF609	O15014	1411 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	MYH7	P12883	1935 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346		A0A0U1RRA0	63 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	SH2D1B	O14796	132 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	SEC22B	O75396	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	SYNGR4	O95473	234 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	IGHV3-13	P01766	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	CXCL10	P02778	98 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	CCDC159	P0C7I6	412 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	OR9G9	P0C7N8	305 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	FOSL2	P15408	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	GSK3B	P49841	420 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	UBE2H	P62256	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	ACY1	Q03154	408 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	EMC2	Q15006	297 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	CARTPT	Q16568	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	LPAL2	Q16609	132 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FARP1-223	ENST00000598346	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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