RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598256.1

LTBP4-222, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 2

Gene LTBP4, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-222	ENST00000598256	MED13	Q9UHV7	2174 aa		14.75	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	DUXA	A6NLW8	204 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	OR12D1	P0DN82	309 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	ETFA	P13804	333 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	MAGEA8	P43361	318 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	MVD	P53602	400 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	CORO7	P57737	925 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	DCAF7	P61962	342 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	PSG6	Q00889	435 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	DUSP5	Q16690	384 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	SLC5A8	Q8N695	610 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	OR10A6	Q8NH74	314 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	CDS1	Q92903	461 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	RAB8B	Q92930	207 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	CRELD1	Q96HD1	420 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	BTBD9	Q96Q07	612 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	STAC	Q99469	402 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	PIGU	Q9H490	435 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	EXD2	Q9NVH0	621 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	CMTM6	Q9NX76	183 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	TMEM247	A6NEH6	219 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	ERICH4	A6NGS2	130 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	FRG2C	A6NGY1	282 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256		A8MUI8	341 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	NME4	O00746	187 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	ASNA1	O43681	348 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	NKX2-2	O95096	273 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	AGR2	O95994	175 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	ITPKB	P27987	946 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	GABRA3	P34903	492 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	PPIC	P45877	212 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	NCALD	P61601	193 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	IFNE	Q86WN2	208 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	PIK3R3	Q92569	461 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	TP53INP1	Q96A56	240 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	LHPP	Q9H008	270 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	ING2	Q9H160	280 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	PIF1	Q9H611	641 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		14.73	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256		K7ENP7	123 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	WWP2	O00308	870 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	HMGN4	O00479	90 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	SOX30	O94993	753 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	DRD5	P21918	477 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	KRT20	P35900	424 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	RFX3	P48380	749 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	MAN2A2	P49641	1150 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	NRG3	P56975	720 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	HPCA	P84074	193 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	SERPINA11	Q86U17	422 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	TAGAP	Q8N103	731 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	C10orf111	Q8N326	155 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	SLC35A4	Q96G79	324 aa		14.72	□□□□□ -0.05
LTBP4-222	ENST00000598256	CDRT15	Q96T59	188 aa		14.72	□□□□□ -0.05

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