RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591833.5

SEPT9-240, Transcript of septin 9, human

TSL 4

Gene SEPT9, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEPT9-240	ENST00000591833	PLLP	Q9Y342	182 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	SERTM1	A2A2V5	107 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	GNB5	O14775	395 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	ESRRB	O95718	433 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	GSTA1	P08263	222 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	CTSS	P25774	331 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	HMOX2	P30519	316 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	OPRM1	P35372	400 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	ART1	P52961	327 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	NAGLU	P54802	743 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	PKNOX1	P55347	436 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	PPP2R2A	P63151	447 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	EIPR1	Q53HC9	387 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	MMP21	Q8N119	569 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	BTBD9	Q96Q07	612 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	NODAL	Q96S42	347 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	RASSF1	Q9NS23	344 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	EHD3	Q9NZN3	535 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		13	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	PCDH7	O60245	1069 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	DLX3	O60479	287 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	UGT2B11	O75310	529 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	GOSR1	O95249	250 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	CYP4B1	P13584	511 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	PCSK2	P16519	638 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	GCA	P28676	217 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	MPI	P34949	423 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	PTGDS	P41222	190 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	ZNF136	P52737	540 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	SLC18A1	P54219	525 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	PRKAA2	P54646	552 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	NAA20	P61599	178 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	SORD	Q00796	357 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	DUSP2	Q05923	314 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	LCP2	Q13094	533 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	EFR3A	Q14156	821 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	CEBPE	Q15744	281 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	NNAT	Q16517	81 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	CCDC126	Q96EE4	140 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	SLC35A4	Q96G79	324 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	COL21A1	Q96P44	957 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	TMEM237	Q96Q45	408 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	UCN2	Q96RP3	112 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	TRIB1	Q96RU8	372 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	HBEGF	Q99075	208 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	FOXC2	Q99958	501 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	HEY2	Q9UBP5	337 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	ZFHX3	Q15911	3703 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833		A6NNC1	897 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	PLOD3	O60568	738 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	REM1	O75628	298 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	IL3	P08700	152 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	CT45A8	P0DMV1	189 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	CT45A9	P0DMV2	189 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	KRT20	P35900	424 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	IST1	P53990	364 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	PNLIPRP2	P54317	469 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	CBX1	P83916	185 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	HMGCS1	Q01581	520 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	LTB4R	Q15722	352 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
SEPT9-240	ENST00000591833	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		12.98	□□□□□ -0.33

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms