RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577524.5

ARHGAP28-208, Transcript of Rho GTPase activating protein 28, human

TSL 5

Gene ARHGAP28, Length 535 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	AAGAB	Q6PD74	315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TMEM107	Q6UX40	140 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CROCCP2	Q86T23	111 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	LACC1	Q8IV20	430 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	MMP21	Q8N119	569 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	MZB1	Q8WU39	189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TMBIM1	Q969X1	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	PPCDC	Q96CD2	204 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZNF681	Q96N22	645 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SFXN2	Q96NB2	322 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	GNRHR2	Q96P88	292 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZNF559	Q9BR84	538 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	MYNN	Q9NPC7	610 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	STOML1	Q9UBI4	398 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZNF639	Q9UID6	485 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	EMCN	Q9ULC0	261 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	EDAR	Q9UNE0	448 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	POLE	Q07864	2286 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524		A0A087WV62	115 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ADAM10	O14672	748 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	T	O15178	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	AKAP10	O43572	662 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SCO2	O43819	266 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	PLOD3	O60568	738 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	UGT2B11	O75310	529 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZWINT	O95229	277 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	HSPA4L	O95757	839 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CLPS	P04118	112 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	HPN	P05981	417 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	LINC00032	P0C843	101 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	GLI4	P10075	376 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	PRPS2	P11908	318 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CAPN3	P20807	821 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	S1PR1	P21453	382 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ALDH3A1	P30838	453 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	UQCRC1	P31930	480 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	MC3R	P41968	323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	EMD	P50402	254 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	DGKQ	P52824	942 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TLE4	Q04727	773 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SRY	Q05066	204 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	PCLAF	Q15004	111 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	EIPR1	Q53HC9	387 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TRABD2A	Q86V40	505 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARHGAP28-208	ENST00000577524	IFNE	Q86WN2	208 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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