RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 NME2P1O60361 137 aa30.5■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 DRD4P21917 467 aa30.5■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 NME2P22392 152 aa30.5■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 UQCRC2P22695 453 aa30.5■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 INAQ16352 499 aa30.5■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPATA21Q7Z572 469 aa30.5■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 CPLX4Q7Z7G2 160 aa30.5■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIML2Q8N7C3 387 aa30.5■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 OMA1Q96E52 524 aa30.5■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPDL1Q96EA4 605 aa30.5■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 SERHLQ9NQF3 203 aa30.5■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPATCH2Q9NW75 528 aa30.5■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPM1BO75688 479 aa30.49■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYP27C1Q4G0S4 372 aa30.49■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa30.49■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM13CQ8NE31 585 aa30.49■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC9A6Q92581 669 aa30.49■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMBIM1Q969X1 311 aa30.49■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 ITCHQ96J02 903 aa30.49■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 INPP5KQ9BT40 448 aa30.49■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 SH2D2AQ9NP31 389 aa30.49■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 NR5A2O00482 541 aa30.48■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 RFXANKO14593 260 aa30.48■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 NKX2-2O95096 273 aa30.48■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 GAB1Q13480 694 aa30.48■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC16A11Q8NCK7 471 aa30.48■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR10G3Q8NGC4 313 aa30.48■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4N2Q8NGD1 307 aa30.48■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 PAQR8Q8TEZ7 354 aa30.48■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 C16orf58Q96GQ5 468 aa30.48■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACTRT3Q9BYD9 372 aa30.48■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAP10Q9P2G4 905 aa30.48■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 VPS4AQ9UN37 437 aa30.48■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTLL8A6PVC2 850 aa30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 TP53I11O14683 189 aa30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT16P08779 473 aa30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 GABRA3P34903 492 aa30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT20P35900 424 aa30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXW4P57775 412 aa30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC22A10Q63ZE4 541 aa30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDC73Q6P1J9 531 aa30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 C6orf120Q7Z4R8 191 aa30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5M3Q8NGP4 307 aa30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 JADE3Q92613 823 aa30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC52A3Q9NQ40 469 aa30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 GIN1Q9NXP7 522 aa30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 CBLCQ9ULV8 474 aa30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 EML6Q6ZMW3 1958 aa30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALOX5P09917 674 aa30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACP2P11117 423 aa30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDKN2CP42773 168 aa30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLEC4FQ8N1N0 589 aa30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXO30Q8TB52 745 aa30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR151Q8TDV0 419 aa30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC35A5Q9BS91 424 aa30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 YIPF4Q9BSR8 244 aa30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 SAR1AQ9NR31 198 aa30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 DUSP22Q9NRW4 184 aa30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 SACM1LQ9NTJ5 587 aa30.47■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR6C70A6NIJ9 312 aa30.46■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCB7O75027 752 aa30.46■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 SOX30O94993 753 aa30.46■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 RASAL1O95294 804 aa30.46■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCL3P10147 92 aa30.46■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAPN3P20807 821 aa30.46■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF621Q6ZSS3 439 aa30.46■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 GTF2H4Q92759 462 aa30.46■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC35A4Q96G79 324 aa30.46■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 STACQ99469 402 aa30.46■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 CNIH4Q9P003 139 aa30.46■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa30.45■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNX3O60493 162 aa30.45■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 REM1O75628 298 aa30.45■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 P04436 131 aa30.45■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL12BP29460 328 aa30.45■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIGAP37287 484 aa30.45■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 C19orf57Q0VDD7 668 aa30.45■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 DUSP5Q16690 384 aa30.45■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 DECR1Q16698 335 aa30.45■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 C6orf10Q5SRN2 563 aa30.45■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUP54Q7Z3B4 507 aa30.45■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 NEURL3Q96EH8 262 aa30.45■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 COL21A1Q96P44 957 aa30.45■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIGUQ9H490 435 aa30.45■■■□□ 2.47
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PP18 115 aa30.44■■■□□ 2.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSPAN2O60636 221 aa30.44■■■□□ 2.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNH1O95259 989 aa30.44■■■□□ 2.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANP32DO95626 131 aa30.44■■■□□ 2.46
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZCCHC18P0CG32 403 aa30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.8 ms