RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 TMBIM1Q969X1 311 aa15.15■□□□□ 0.02
SPNS1-211ENST00000568829 SLC35A4Q96G79 324 aa15.15■□□□□ 0.02
SPNS1-211ENST00000568829 WDYHV1Q96HA8 205 aa15.15■□□□□ 0.02
SPNS1-211ENST00000568829 RHOXF2Q9BQY4 288 aa15.15■□□□□ 0.02
SPNS1-211ENST00000568829 SDHAF3Q9NRP4 125 aa15.15■□□□□ 0.02
SPNS1-211ENST00000568829 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SPNS1-211ENST00000568829 TAS2R10Q9NYW0 307 aa15.15■□□□□ 0.02
SPNS1-211ENST00000568829 HEY2Q9UBP5 337 aa15.15■□□□□ 0.02
SPNS1-211ENST00000568829 MAPRE3Q9UPY8 281 aa15.15■□□□□ 0.02
SPNS1-211ENST00000568829 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SPNS1-211ENST00000568829 PDZD2O15018 2839 aa15.15■□□□□ 0.02
SPNS1-211ENST00000568829 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 NINQ8N4C6 2090 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 TTC36A6NLP5 189 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 H0Y3Z8 333 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 DDX5P17844 614 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 SRD5A2P31213 254 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 DGKQP52824 942 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 HMGCS1Q01581 520 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 C2orf80Q0P641 193 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 GAB1Q13480 694 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 LTB4RQ15722 352 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 CEBPEQ15744 281 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 FLYWCH1Q4VC44 716 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 FBXW10Q5XX13 1052 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 ZYG11AQ6WRX3 759 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 IKBIPQ70UQ0 350 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP15.14■□□□□ 0.012e-6■■□□□ 11.8
SPNS1-211ENST00000568829 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 ZZZ3Q8IYH5 903 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 MMP21Q8N119 569 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 APIPQ96GX9 242 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 NODALQ96S42 347 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 ADOQ96SZ5 270 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 C3orf14Q9HBI5 128 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 SERHLQ9NQF3 203 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 DKKL1Q9UK85 242 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 TIMM22Q9Y584 194 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 WIF1Q9Y5W5 379 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 POLQO75417 2590 aa15.14■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 A0A087WV62 115 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 TUBAL3A6NHL2 446 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 CTAG2O75638 210 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 HCFC1P51610 2035 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 NAGLUP54802 743 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 DNAJB13P59910 316 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 SORDQ00796 357 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 CYP27C1Q4G0S4 372 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 FAM180BQ6P0A1 224 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 SEM1Q6ZVN7 128 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 OR4K17Q8NGC6 315 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 CDC26Q8NHZ8 85 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 KAT2AQ92830 837 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 NTNG2Q96CW9 530 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 VSTM2LQ96N03 204 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 SFXN3Q9BWM7 321 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 OR2B2Q9GZK3 357 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 FOLH1BQ9HBA9 442 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 GALNT9Q9HCQ5 603 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 Q9N2J8 555 aa15.13■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 LINC01387J3KSC0 135 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 CHEK2O96017 543 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 CT45A8P0DMV1 189 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 CT45A9P0DMV2 189 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 UROSP10746 265 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 CHN1P15882 459 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 ART1P52961 327 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 DIO3P55073 304 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 DLX5P56178 289 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 RAE1P78406 368 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 TESK1Q15569 626 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 DECR1Q16698 335 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 CT45A2Q5DJT8 189 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 TRIM46Q7Z4K8 759 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 WNT2BQ93097 391 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 SFXN2Q96NB2 322 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 EBPLQ9BY08 206 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 GSTO2Q9H4Y5 243 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 PTGES2Q9H7Z7 377 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 TAS2R7Q9NYW3 318 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 STOML1Q9UBI4 398 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 ABCG2Q9UNQ0 655 aa15.12■□□□□ 0.01
SPNS1-211ENST00000568829 MYO1GB0I1T2 1018 aa15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms